More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0820 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0820  quinolinate synthetase  100 
 
 
298 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14914  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2353  quinolinate synthetase  55.63 
 
 
300 aa  324  9e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.69 
 
 
295 aa  317  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1664  quinolinate synthetase A  54.52 
 
 
300 aa  311  5.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.358853  unclonable  0.000000000000205147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1431  quinolinate synthetase  47.67 
 
 
305 aa  289  3e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.918006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0488  quinolinate synthetase  47.54 
 
 
305 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147805  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0556  quinolinate synthetase  46.67 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0546  quinolinate synthetase  49 
 
 
305 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0349  quinolinate synthetase  46.67 
 
 
305 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.772142  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.5 
 
 
306 aa  270  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1185  quinolinate synthetase  45.95 
 
 
298 aa  258  8e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1147  quinolinate synthetase  45.61 
 
 
298 aa  254  9e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.48 
 
 
303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1975  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.52 
 
 
311 aa  251  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  46 
 
 
306 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  44.33 
 
 
303 aa  248  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.49 
 
 
302 aa  248  9e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  41 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.16 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.82 
 
 
298 aa  240  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1792  quinolinate synthetase  42.71 
 
 
308 aa  238  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  41 
 
 
304 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.46 
 
 
333 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.22 
 
 
304 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  45.39 
 
 
334 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  43.43 
 
 
306 aa  236  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2202  quinolinate synthetase  43 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.189573  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  41.78 
 
 
323 aa  235  7e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.8 
 
 
298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.37 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.33 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.02 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1583  quinolinate synthetase  39.8 
 
 
303 aa  233  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.019582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  45 
 
 
307 aa  232  7.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  43.39 
 
 
351 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  41.47 
 
 
304 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  45.73 
 
 
327 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.78 
 
 
333 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  44.08 
 
 
334 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  44.08 
 
 
334 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.76 
 
 
338 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  44.08 
 
 
334 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  46.15 
 
 
302 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  41.47 
 
 
305 aa  225  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  42.47 
 
 
304 aa  225  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  46.44 
 
 
323 aa  225  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  45.76 
 
 
323 aa  224  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  45.48 
 
 
302 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  45.55 
 
 
327 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  43.92 
 
 
307 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  45.48 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  43.39 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  45.45 
 
 
324 aa  222  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  44.07 
 
 
323 aa  221  9e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  39.87 
 
 
307 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.02 
 
 
328 aa  221  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  40.13 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  43.73 
 
 
323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  42.33 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  42.38 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.07 
 
 
357 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.2 
 
 
304 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.41 
 
 
357 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  39.67 
 
 
308 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.07 
 
 
347 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  39.74 
 
 
321 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  40 
 
 
332 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  39.33 
 
 
319 aa  216  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.95 
 
 
346 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  47.14 
 
 
323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  40.47 
 
 
304 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  40.13 
 
 
304 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  46.8 
 
 
323 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  39.27 
 
 
322 aa  215  7e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.73 
 
 
343 aa  215  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.41 
 
 
345 aa  215  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  40.47 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  43.23 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  40.67 
 
 
304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  40.71 
 
 
343 aa  212  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  41.56 
 
 
331 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  42.66 
 
 
359 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  41.03 
 
 
343 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3166  quinolinate synthetase  44.26 
 
 
334 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000173598  hitchhiker  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.41 
 
 
303 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.49 
 
 
334 aa  208  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  40 
 
 
323 aa  208  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2965  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.37 
 
 
348 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  39.32 
 
 
306 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  42.37 
 
 
370 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  42.76 
 
 
343 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  35.91 
 
 
301 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  39.74 
 
 
318 aa  206  5e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  42.62 
 
 
308 aa  205  6e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  35.91 
 
 
301 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  41.61 
 
 
370 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  37.01 
 
 
314 aa  204  1e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  42.37 
 
 
370 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.89 
 
 
310 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  39.67 
 
 
308 aa  203  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>