14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0810 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0810  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  100 
 
 		 232 aa  442  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00450411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2703  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  40.76 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1340  ABC transporter, permease protein, putative  31.95 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1122  ABC transporter, permease protein  28.98 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1151  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 231 aa  95.5  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1531  hypothetical protein  25.14 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.194953  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  33.06 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  29.03 
 
 		 274 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  29.27 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  29.63 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  26.67 
 
 		 274 aa  42  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 274 aa  42  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>