36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0578 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0578  ribosomal protein S14  100 
 
 		 59 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.104064  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0095  30S ribosomal protein S14P  80 
 
 		 56 aa  83.2  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.450951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0456  30S ribosomal protein S14P  74 
 
 		 51 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0546  30S ribosomal protein S14P  75.51 
 
 		 51 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355723  normal  0.314336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2239  30S ribosomal protein S14P  79.07 
 
 		 56 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000503282  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0015  30S ribosomal protein S14P  75.56 
 
 		 50 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.67188e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1714  ribosomal protein S14  77.78 
 
 		 47 aa  72.8  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00614763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0096  30S ribosomal protein S14P  66.67 
 
 		 50 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000254546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31044  RPS29A; ribosomal protein S29A (S36A) (YS29)  50.88 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167387  normal  0.57563 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11411  40S ribosomal protein S29 (Eurofung)  56.82 
 
 		 56 aa  57.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1260  30S ribosomal protein S14P  60 
 
 		 53 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0658  30S ribosomal protein S14P  60 
 
 		 53 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0165  30S ribosomal protein S14P  60 
 
 		 53 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000451601  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1764  ribosomal protein S14  55.81 
 
 		 54 aa  57  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.351928  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0724  30S ribosomal protein S14P  57.78 
 
 		 53 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159665  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0105  30S ribosomal protein S14P  54.55 
 
 		 54 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000005595  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2306  30S ribosomal protein S14P  50 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0224  ribosomal protein S14  45.59 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164252  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2232  ribosomal protein S14  58.33 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2435  30S ribosomal protein S14P  54.17 
 
 		 57 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0177  30S ribosomal protein S14P  48.84 
 
 		 54 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1842  ribosomal protein S14  45.65 
 
 		 54 aa  51.6  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0796  30S ribosomal protein S14  40.35 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.250712 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42310  Ribosomal protein S29, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  46.51 
 
 		 56 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.243143  normal  0.393966 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1864  30S ribosomal protein S14P  46.51 
 
 		 54 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1507  ribosomal protein S14  53.33 
 
 		 53 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.59133e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2010  30S ribosomal protein S14P  48.84 
 
 		 54 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.866444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0241  30S ribosomal protein S14P  46.67 
 
 		 54 aa  50.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1398  30S ribosomal protein S14P  50 
 
 		 53 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1842  ribosomal protein S14  63.89 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04290  conserved hypothetical protein  46.67 
 
 		 54 aa  47.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.546532  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1258  30S ribosomal protein S14P  44.19 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4131  ribosomal protein S14  55.56 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43539  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28147  predicted protein  46 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0228  ribosomal protein S14  46 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229015  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3654  ribosomal protein S14  61.76 
 
 		 56 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000678184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>