28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0415 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0415  50S ribosomal protein L12P  100 
 
 
105 aa  191  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18162  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0654  50S ribosomal protein L12P  65.71 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00068543  normal  0.300749 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0165  50S ribosomal protein L12P  70.48 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.589504 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1948  50S ribosomal protein L12P  68.57 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0442001  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2249  50S ribosomal protein L12P  72.38 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  unclonable  0.0000000000341588  normal  0.119729 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1699  50S ribosomal protein L12P  59.7 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0899103 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0878  50S ribosomal protein L12P  65.08 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0187  50S ribosomal protein L12P  76.36 
 
 
99 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1579  50S ribosomal protein L12P  71.43 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00723578  hitchhiker  0.00569921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0612  50S ribosomal protein L12P  76 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000227092  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1519  ribosomal protein 60S  63.64 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1637  50S ribosomal protein L12P  55.24 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.461477  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3520  ribosomal protein 60S  61.82 
 
 
113 aa  73.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.107265  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1419  50S ribosomal protein L12P  57.14 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.893644  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1709  50S ribosomal protein L12P  59.26 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.49137  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0720  50S ribosomal protein L12P  64.81 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0256  50S ribosomal protein L12P  62.75 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2533  50S ribosomal protein L12P  66 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386824  normal  0.269455 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2184  ribosomal protein 60S  64 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.603129  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0784  50S ribosomal protein L12P  61.11 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0621  50S ribosomal protein L12P  59.26 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0374  50S ribosomal protein L12P  64.71 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1271  50S ribosomal protein L12P  73.47 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1314  ribosomal protein 60S  55.56 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1415  50S ribosomal protein L12P  69.39 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0695  50S ribosomal protein L12P  69.39 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1261  50S ribosomal protein L12P  69.39 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0732344  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0860  ribosomal protein 60S  53.33 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>