44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_R0003 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_R0002  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0003  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0073  tRNA-Tyr  96.51 
 
 		 86 bp  147  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0021  tRNA-Tyr  90.14 
 
 		 83 bp  85.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0028  tRNA-Tyr  90.62 
 
 		 83 bp  79.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0846245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0009  tRNA-Tyr  90.62 
 
 		 83 bp  79.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0007  tRNA-Tyr  88.73 
 
 		 83 bp  77.8  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0265739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  89.04 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  90.28 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  89.19 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATyrVIMSS1309156  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0015  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATyrVIMSS1309080  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATyrVIMSS1309112  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.722386  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0007  tRNA-Tyr  97.06 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312079  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  88.41 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0019  tRNA-Tyr  87.69 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.164183  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0042  tRNA-Tyr  86.11 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0022  tRNA-Tyr  86.11 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0313146  normal  0.1141 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  86.67 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATyrVIMSS1309201  tRNA-Tyr  86.11 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0854141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNATyrVIMSS1309353  tRNA-Tyr  86.11 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNATyrVIMSS1309298  tRNA-Tyr  86.11 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0675624 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  86.67 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0007  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000157532  hitchhiker  0.000000000121254 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0047  tRNA-Tyr  86.57 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  88.41 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0036  tRNA-Tyr  84.93 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0058  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0068  tRNA-Tyr  86.54 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0054  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0033  tRNA-Tyr  85.94 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0056  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467889  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0007  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.737709 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t23  tRNA-Tyr  85.94 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0034  tRNA-Tyr  85.94 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1215  tRNA-Tyr  85.94 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0315  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171426  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1874  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0618202  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0006  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0035  tRNA-Tyr  87.04 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0046  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>