169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1921 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2089  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.92 
 
 		 536 aa  771    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0523269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3144  phosphoenolpyruvate carboxykinase  85.71 
 
 		 539 aa  954    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0350  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.92 
 
 		 538 aa  748    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.391581  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.43 
 
 		 532 aa  683    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0461  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.98 
 
 		 537 aa  773    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2908  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.33 
 
 		 534 aa  662    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.775777  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0535  phosphoenolpyruvate carboxykinase  61.6 
 
 		 535 aa  681    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1639  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 539 aa  1112    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0138772  normal  0.211058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0599  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.66 
 
 		 537 aa  773    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.42 
 
 		 537 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000921234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0363  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.98 
 
 		 537 aa  773    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117226  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0445  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.18 
 
 		 538 aa  747    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1921  phosphoenolpyruvate carboxykinase  100 
 
 		 539 aa  1112    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2442  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.31 
 
 		 532 aa  699    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.451233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2046  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.8 
 
 		 561 aa  660    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0742048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3970  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.67 
 
 		 536 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3502  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.36 
 
 		 536 aa  771    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1100  phosphoenolpyruvate carboxykinase  66.79 
 
 		 537 aa  733    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.814328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2852  phosphoenolpyruvate carboxykinase  63.64 
 
 		 532 aa  699    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4297  phosphoenolpyruvate carboxykinase  68.42 
 
 		 536 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0313  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.43 
 
 		 532 aa  683    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2566  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.24 
 
 		 532 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0223  phosphoenolpyruvate carboxykinase  80.11 
 
 		 536 aa  871    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7365  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.73 
 
 		 537 aa  751    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5391  phosphoenolpyruvate carboxykinase  64.13 
 
 		 564 aa  677    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.925553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0403  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.34 
 
 		 532 aa  708    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  0.0144592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3253  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.9 
 
 		 536 aa  751    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0829  phosphoenolpyruvate carboxykinase  69.57 
 
 		 536 aa  767    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0109  phosphoenolpyruvate carboxykinase  65.28 
 
 		 537 aa  719    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.550935  normal  0.275984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2843  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.97 
 
 		 558 aa  798    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5431  phosphoenolpyruvate carboxykinase  79.18 
 
 		 536 aa  862    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  67.84 
 
 		 536 aa  747    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1375  phosphoenolpyruvate carboxykinase  71.78 
 
 		 536 aa  816    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.875002 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0213  phosphoenolpyruvate carboxykinase  62.86 
 
 		 532 aa  698    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1593  phosphoenolpyruvate carboxykinase  96.1 
 
 		 539 aa  1046    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239491  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1886  phosphoenolpyruvate carboxykinase  58.74 
 
 		 551 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  56.25 
 
 		 529 aa  600  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.18 
 
 		 534 aa  592  1e-168  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000435432  hitchhiker  0.000000000104521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0871  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.9 
 
 		 530 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.549983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3603  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.59 
 
 		 530 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0633  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.01 
 
 		 525 aa  561  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000533993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1893  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.24 
 
 		 526 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0173084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3169  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.54 
 
 		 530 aa  558  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000302489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0658  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.85 
 
 		 528 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1393  phosphoenolpyruvate carboxykinase  54.07 
 
 		 539 aa  554  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0733  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.22 
 
 		 537 aa  551  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2779  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.76 
 
 		 523 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0748  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.84 
 
 		 529 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1134  phosphoenolpyruvate carboxykinase  53.41 
 
 		 513 aa  544  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000731293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0680  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.82 
 
 		 532 aa  539  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0369  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.71 
 
 		 538 aa  540  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4595  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.81 
 
 		 528 aa  532  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4076  phosphoenolpyruvate carboxykinase  52.85 
 
 		 526 aa  530  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2776  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.43 
 
 		 572 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3438  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.9 
 
 		 528 aa  527  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0013049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0361  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.43 
 
 		 528 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0203632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1353  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.84 
 
 		 530 aa  518  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.866252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4661  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.24 
 
 		 528 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4501  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.24 
 
 		 528 aa  518  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4518  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.24 
 
 		 528 aa  519  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4887  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.24 
 
 		 528 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5019  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.24 
 
 		 528 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0789117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4906  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.24 
 
 		 528 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4916  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.05 
 
 		 528 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4042  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.86 
 
 		 571 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4079  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.86 
 
 		 571 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4879  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.05 
 
 		 528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00965409  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1509  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.12 
 
 		 525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.435783  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0965  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.31 
 
 		 525 aa  514  1e-144  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1366  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.49 
 
 		 534 aa  510  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1842  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.91 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1878  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.91 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0165  phosphoenolpyruvate carboxykinase  51.27 
 
 		 513 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1486  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.86 
 
 		 524 aa  503  1e-141  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2591  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.14 
 
 		 549 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406623 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0392  phosphoenolpyruvate carboxykinase  50.52 
 
 		 499 aa  499  1e-140  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0898172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6930  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.82 
 
 		 533 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.518849  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4091  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.74 
 
 		 533 aa  495  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1294  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.15 
 
 		 525 aa  495  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01655  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.87 
 
 		 536 aa  491  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1196  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.79 
 
 		 524 aa  488  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0606  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  47.98 
 
 		 525 aa  486  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2005  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  46.9 
 
 		 529 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.37064 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1696  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.17 
 
 		 528 aa  479  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0939  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.55 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0882  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.15 
 
 		 524 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.490895  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1874  phosphoenolpyruvate carboxykinase  47.45 
 
 		 533 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000477195  normal  0.147307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4740  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.02 
 
 		 513 aa  475  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55018  phosphoenolpyruvate carboxykinase  46.53 
 
 		 612 aa  478  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1010  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.78 
 
 		 524 aa  475  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.22 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1197  phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)  48.51 
 
 		 531 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0147  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.22 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1049  phosphoenolpyruvate carboxykinase  45.65 
 
 		 520 aa  473  1e-132  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0162  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.03 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0152  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.03 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4210  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.03 
 
 		 513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3623  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.44 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0145  phosphoenolpyruvate carboxykinase  49.22 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4362  phosphoenolpyruvate carboxykinase  48.25 
 
 		 513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>