11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0010 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0010  tRNA-Gln  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.78413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0012  tRNA-Gln  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000171434  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0001  tRNA-Gln  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.753246 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0003  tRNA-Gln  90.41 
 
 
73 bp  89.7  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.270381  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0039  tRNA-Gln  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117247  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0056  tRNA-Gln  95.12 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0607311  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0013  tRNA-Gln  89.47 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0422006 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0014  tRNA-Gln  92.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0037  tRNA-Gln  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0015  tRNA-Gln  85.45 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.616091  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0038  tRNA-Gln  91.43 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250632  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>