176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3581 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3581  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  100 
 
 
298 aa  596  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0421  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  82.55 
 
 
298 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0919  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  76.17 
 
 
297 aa  455  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2322  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  71.14 
 
 
298 aa  435  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0009  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  72.39 
 
 
298 aa  436  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0008  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  71.38 
 
 
298 aa  432  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4060  pyridoxine biosynthesis protein  70.95 
 
 
300 aa  428  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1248  pyridoxine biosynthesis protein  72.64 
 
 
302 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4872  pyridoxine biosynthesis protein  72.3 
 
 
300 aa  426  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0056  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  71.96 
 
 
301 aa  426  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0183789  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3313  pyridoxine biosynthesis protein  71.62 
 
 
304 aa  424  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2228  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  70.37 
 
 
298 aa  421  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1649  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  69.93 
 
 
301 aa  416  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2223  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  69.26 
 
 
302 aa  408  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.775463  normal  0.668659 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0009  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  66.21 
 
 
294 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000701553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0012  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.99 
 
 
295 aa  401  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121717  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0009  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  67.93 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000232044  unclonable  0.00000000788382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0010  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  66.55 
 
 
294 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.483005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0617  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  66.55 
 
 
294 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0495226  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0007  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  68.28 
 
 
293 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.396026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1926  pyridoxine biosynthesis protein  66.55 
 
 
301 aa  394  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.394842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4348  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  66.21 
 
 
294 aa  394  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000379019  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1316  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  67.01 
 
 
299 aa  395  1e-109  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0011  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  64.6 
 
 
294 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000284564  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1106  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.08 
 
 
303 aa  391  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00472743  decreased coverage  0.00164202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2069  pyridoxine biosynthesis protein  65.52 
 
 
304 aa  391  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1348  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  66.33 
 
 
322 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10142  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0011  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.79 
 
 
294 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5149  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  66.21 
 
 
321 aa  391  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0075588  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0010  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  64.48 
 
 
295 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000364986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0011  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.45 
 
 
295 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000530054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0014  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.45 
 
 
295 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0013  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.1 
 
 
295 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0014  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.45 
 
 
295 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0011  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.45 
 
 
295 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000606232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5304  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.45 
 
 
295 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000184713  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0011  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.45 
 
 
295 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0010  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.1 
 
 
295 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000115977  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1366  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  64.86 
 
 
310 aa  388  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2105  pyridoxine biosynthesis protein  65.52 
 
 
305 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.368424  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2564  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.29 
 
 
305 aa  387  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0362  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  64.85 
 
 
293 aa  388  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0010  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.79 
 
 
295 aa  388  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0016  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.45 
 
 
295 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000359602  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1898  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.87 
 
 
293 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.158468  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2040  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.86 
 
 
308 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2248  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.17 
 
 
322 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1760  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.52 
 
 
303 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.338605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2295  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.17 
 
 
322 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6121  snz1; pyridoxine biosynthesis protein ; K06215 pyridoxine biosynthesis protein  64.83 
 
 
304 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0300871  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2287  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.17 
 
 
322 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0415  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  66.32 
 
 
294 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00249205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3832  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.29 
 
 
333 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.161137 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1346  pyridoxine biosynthesis protein  59.52 
 
 
336 aa  385  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.657556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3808  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  67.13 
 
 
293 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0844  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.88 
 
 
299 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.979459  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15370  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.52 
 
 
298 aa  383  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0269861  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2314  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.17 
 
 
308 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0940481  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1573  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.2 
 
 
299 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000215289  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0036  pyridoxine biosynthesis protein  62.24 
 
 
358 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1113  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.31 
 
 
299 aa  383  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1102  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.54 
 
 
299 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1751  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.87 
 
 
291 aa  381  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2241  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  64.69 
 
 
292 aa  381  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.126542  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19930  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.52 
 
 
314 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2936  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.14 
 
 
293 aa  378  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.009296  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1036  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.67 
 
 
294 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.111237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3415  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.79 
 
 
312 aa  378  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.000106883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2108  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.79 
 
 
322 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00868127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12625  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  64.83 
 
 
299 aa  378  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2349  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.79 
 
 
303 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0012  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.45 
 
 
294 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.399865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1484  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  68.03 
 
 
295 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.898555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14990  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  62.76 
 
 
304 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1662  pyridoxine biosynthesis protein  63.79 
 
 
306 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11357  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1109  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  62.2 
 
 
296 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0188768  hitchhiker  0.0000000000000304539 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57750  predicted protein  63.41 
 
 
292 aa  375  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.31588  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1986  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.79 
 
 
307 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062931 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0447  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  64.63 
 
 
293 aa  375  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669872  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0039  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.76 
 
 
298 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1859  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  65.86 
 
 
292 aa  376  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000208333  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0462  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  64.63 
 
 
293 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07725  Pyridoxine biosynthesis protein pyroA (Pdx1 homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9UW83]  64.04 
 
 
304 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.33756  normal  0.166674 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2040  pyridoxine biosynthesis protein  62.38 
 
 
303 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0143825  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2293  pyridoxine biosynthesis protein  65.29 
 
 
305 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1545  pyridoxine biosynthesis protein  63.82 
 
 
293 aa  371  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0340572  hitchhiker  0.00365264 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_324  pyridoxine biosynthesis protein  64.85 
 
 
293 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.244018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1790  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.32 
 
 
306 aa  371  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0945843  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0541  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  61.38 
 
 
295 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1789  pyridoxine biosynthesis protein  63.45 
 
 
304 aa  373  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0203769  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0555  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  61.38 
 
 
295 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1777  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  64.71 
 
 
306 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1600  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.29 
 
 
300 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0380  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  64.83 
 
 
293 aa  367  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0158  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  60.34 
 
 
295 aa  368  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29885  predicted protein  64.26 
 
 
336 aa  368  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.780299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3182  pyridoxine biosynthesis protein  62.41 
 
 
302 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0007  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.51 
 
 
294 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2381  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  63.64 
 
 
309 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2410  pyridoxine biosynthesis protein  61.38 
 
 
302 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.124427 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>