97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2875 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2875  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  284  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.684697  normal  0.334208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3284  hypothetical protein  78.17 
 
 		 142 aa  227  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0251372  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  63.2 
 
 		 561 aa  159  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  36.11 
 
 		 1862 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  39.73 
 
 		 1356 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  40.48 
 
 		 1682 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  39.24 
 
 		 840 aa  52.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  43.94 
 
 		 978 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  40.48 
 
 		 1882 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  42.42 
 
 		 615 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  40.48 
 
 		 547 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  45.21 
 
 		 2000 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  44.44 
 
 		 1094 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  43.84 
 
 		 2122 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40.58 
 
 		 1241 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  37.97 
 
 		 1667 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  38.1 
 
 		 575 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  40 
 
 		 963 aa  50.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  40.48 
 
 		 1969 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  35.29 
 
 		 644 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  39.29 
 
 		 2272 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  43.84 
 
 		 791 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  42.42 
 
 		 685 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  42.42 
 
 		 669 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  42.42 
 
 		 400 aa  48.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  34.41 
 
 		 996 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  38.55 
 
 		 1120 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  40.91 
 
 		 679 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  44.44 
 
 		 929 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  39.76 
 
 		 1300 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  39.76 
 
 		 1842 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  39.71 
 
 		 581 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  40 
 
 		 752 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  37.14 
 
 		 1732 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  39.34 
 
 		 2554 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  39.76 
 
 		 2036 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  40.28 
 
 		 735 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  34.85 
 
 		 684 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  41.67 
 
 		 675 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  34.72 
 
 		 530 aa  47.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  35.9 
 
 		 719 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  42.65 
 
 		 500 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  40.91 
 
 		 567 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  41.82 
 
 		 1528 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.57 
 
 		 594 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  36.9 
 
 		 211 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.75 
 
 		 845 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  34.72 
 
 		 930 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  35.94 
 
 		 519 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 786 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  36.76 
 
 		 930 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1340  PKD domain-containing protein  36.23 
 
 		 373 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  39.71 
 
 		 460 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  37.68 
 
 		 3295 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  41.18 
 
 		 713 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  43.75 
 
 		 658 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  36.23 
 
 		 941 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  38.81 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  36.49 
 
 		 1042 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  37.88 
 
 		 816 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  33.82 
 
 		 1056 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  34.94 
 
 		 374 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  37.88 
 
 		 560 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  37.35 
 
 		 551 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  34.18 
 
 		 802 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  32.86 
 
 		 958 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1830 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  36.99 
 
 		 910 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  36.92 
 
 		 859 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  36.36 
 
 		 1189 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  31.4 
 
 		 443 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  36.36 
 
 		 838 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  39.39 
 
 		 1231 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  34.18 
 
 		 870 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  32.14 
 
 		 1361 aa  43.5  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  33.75 
 
 		 823 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  38.24 
 
 		 819 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  35.21 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2607  PKD  27.83 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  38.98 
 
 		 1236 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  37.93 
 
 		 1011 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  36 
 
 		 587 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  34.72 
 
 		 777 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  40.98 
 
 		 1931 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  34.78 
 
 		 528 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  37.88 
 
 		 865 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  39.06 
 
 		 869 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  34.67 
 
 		 2176 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  31.34 
 
 		 1387 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  39.66 
 
 		 1987 aa  40.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  33.78 
 
 		 2552 aa  40.8  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  38.18 
 
 		 861 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  40 
 
 		 1092 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  29.79 
 
 		 1783 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  38.36 
 
 		 952 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 1158 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  38.71 
 
 		 439 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>