76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0061 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0061  putative deoxyhypusine synthase  100 
 
 
317 aa  659    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0184  putative deoxyhypusine synthase  57.7 
 
 
312 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0029  putative deoxyhypusine synthase  57.57 
 
 
311 aa  354  1e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1200  putative deoxyhypusine synthase  56.54 
 
 
308 aa  349  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2546  putative deoxyhypusine synthase  54.33 
 
 
306 aa  342  7e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.482649 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2349  putative deoxyhypusine synthase  54.19 
 
 
311 aa  338  5e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0154  putative deoxyhypusine synthase  51.76 
 
 
312 aa  334  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.124877  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2574  putative deoxyhypusine synthase  52.65 
 
 
336 aa  333  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116993  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1329  putative deoxyhypusine synthase  49.85 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.644418 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3109  deoxyhypusine synthase  48.47 
 
 
357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1997  putative deoxyhypusine synthase  44.81 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.428923  normal  0.191458 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1180  putative deoxyhypusine synthase  40.07 
 
 
339 aa  226  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2038  putative deoxyhypusine synthase  36.73 
 
 
345 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.1291  normal  0.264826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2903  putative deoxyhypusine synthase  36.63 
 
 
322 aa  200  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1799  putative deoxyhypusine synthase  36.63 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.470031  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2389  putative deoxyhypusine synthase  35.22 
 
 
323 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.74286 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0041  deoxyhypusine synthase  33.22 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2876  deoxyhypusine synthase-like protein  34.19 
 
 
349 aa  172  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2089  deoxyhypusine synthase-like protein  33.64 
 
 
349 aa  172  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0073  deoxyhypusine synthase-like protein  35.03 
 
 
349 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2699  deoxyhypusine synthase-like protein  34.19 
 
 
349 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2480  deoxyhypusine synthase-like protein  33.44 
 
 
349 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2484  deoxyhypusine synthase-like protein  33.65 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0839  deoxyhypusine synthase-like protein  35.15 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0732  deoxyhypusine synthase-like protein  35.15 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1276  deoxyhypusine synthase-like protein  33.85 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2235  deoxyhypusine synthase-like protein  32.59 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0578159  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1464  deoxyhypusine synthase-like protein  35.81 
 
 
375 aa  164  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.781396  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4976  deoxyhypusine synthase-like protein  34.4 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1485  deoxyhypusine synthase  34.58 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0390114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0257  deoxyhypusine synthase-like protein  33.77 
 
 
350 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1896  deoxyhypusine synthase-like protein  33.94 
 
 
383 aa  162  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0708136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4663  deoxyhypusine synthase-like protein  34.46 
 
 
350 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1868  deoxyhypusine synthase  31.35 
 
 
324 aa  158  9e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3738  Deoxyhypusine synthase  31.48 
 
 
323 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0166  deoxyhypusine synthase-like protein  32.76 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1753  putative deoxyhypusine synthase  31.8 
 
 
310 aa  152  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000310195  normal  0.0979592 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0928  deoxyhypusine synthase-like protein  33.12 
 
 
354 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.646253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1946  Deoxyhypusine synthase  28.66 
 
 
312 aa  148  9e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0305286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1942  deoxyhypusine synthase  33.53 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168438  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0648  putative deoxyhypusine synthase  30.42 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1312  deoxyhypusine synthase  27.92 
 
 
367 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0118819 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0976  putative deoxyhypusine synthase  30.48 
 
 
328 aa  142  5e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1539  putative deoxyhypusine synthase  28.35 
 
 
335 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0376  deoxyhypusine synthase-like protein  29.88 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0815  putative deoxyhypusine synthase  27.73 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1136  putative deoxyhypusine synthase  28.57 
 
 
335 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1473  putative deoxyhypusine synthase  29.04 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.333563  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1171  putative deoxyhypusine synthase  30.5 
 
 
295 aa  133  5e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0783  putative deoxyhypusine synthase  27.99 
 
 
292 aa  132  6e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.363261  normal  0.028647 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1142  putative deoxyhypusine synthase  30.83 
 
 
335 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.280864  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1970  putative deoxyhypusine synthase  29.35 
 
 
292 aa  127  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35514  predicted protein  29.61 
 
 
342 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0201246  normal  0.36566 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02480  deoxyhypusine synthase, putative  27.83 
 
 
341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88952  predicted protein  25.6 
 
 
379 aa  122  8e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.64572  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0413  putative deoxyhypusine synthase  28.77 
 
 
328 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46999  predicted protein  27.06 
 
 
420 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.970399  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0861  putative deoxyhypusine synthase  27.89 
 
 
292 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08075  deoxyhypusine synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01740)  23.08 
 
 
390 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.70919  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1873  deoxyhypusine synthase  26.37 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0490  deoxyhypusine synthase  25.32 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2448  deoxyhypusine synthase  26.38 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.914534  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1939  deoxyhypusine synthase  24.91 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.952214  normal  0.0341387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3197  deoxyhypusine synthase  26.05 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3097  deoxyhypusine synthase  25.72 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0229205  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00515  hypothetical protein  24.76 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3292  deoxyhypusine synthase  25.72 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0554122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2079  deoxyhypusine synthase  26.06 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.362575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3135  deoxyhypusine synthase  23.62 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2810  deoxyhypusine synthase  23.64 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1628  deoxyhypusine synthase  24.3 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3399  deoxyhypusine synthase  24.03 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0287  deoxyhypusine synthase  24.91 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.321277  normal  0.0769858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3460  deoxyhypusine synthase  24.03 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0388485  normal  0.010011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1218  deoxyhypusine synthase  23.67 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.28828  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3346  deoxyhypusine synthase  24.68 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>