91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3513 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3513  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  31.67 
 
 
271 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  31.25 
 
 
271 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  31.25 
 
 
271 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  31.25 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  31.25 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  31.25 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  31.25 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  30.08 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  31.25 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  29.66 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  29.66 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  29.66 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  29.66 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  29.66 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3631  Dna-J like membrane chaperone protein  30.8 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  29.86 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  29.22 
 
 
284 aa  82  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  31.28 
 
 
289 aa  82  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  31.74 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  28.69 
 
 
273 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.52 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  27.75 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  27.13 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  26.67 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  30.58 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  26.36 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  26.36 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  26.94 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  48.57 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  26.61 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.02 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424531  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  26.67 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  26.73 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  26.09 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  28.44 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  26.09 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  26.09 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  26.09 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0742  hypothetical protein  32.18 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3828  Dna-J like membrane chaperone protein  48.1 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  24.41 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  28.18 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  25 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.88 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  24.11 
 
 
296 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  28.64 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.84 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  25.62 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  26.09 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.35 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  30.35 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0557  DnaJ-like protein DjlA, putative  28.44 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0438  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  24.42 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  25.55 
 
 
262 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  46.38 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  25.59 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  25.55 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07800  hypothetical protein  31.03 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0234725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  27.96 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.42 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  27.39 
 
 
271 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.84 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0567  Dna-J like membrane chaperone protein  36.14 
 
 
318 aa  58.9  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  45.31 
 
 
277 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  45.31 
 
 
277 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  26.67 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  27.7 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0606  Dna-J like membrane chaperone protein  40.28 
 
 
305 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  26.03 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2252  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.69 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0616  putative chaperonin  23.56 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  22.5 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  34.78 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46770  heat shock protein DnaJ-like protein  29.06 
 
 
253 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0557  DnaJ domain-containing protein  22.4 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0353  heat shock protein DnaJ domain protein  46.15 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2908  molecular chaperone DnaJ family  34.04 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1801  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.38 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2884  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.17 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0207  DnaJ domain-containing protein  22.55 
 
 
273 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2105  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.1 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.1 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3389  heat shock protein DnaJ-like  30.67 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1860  heat shock protein DnaJ-like  26.67 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.75 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32724  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  21.08 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  28.71 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  18.96 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0565  heat shock protein DnaJ domain protein  19.51 
 
 
163 aa  42  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>