42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2608 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2608  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  100 
 
 		 122 aa  249  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000264068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1652  H-NS family protein MvaT  51.26 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2795  H-NS family protein MvaT  51.22 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4883  transcriptional regulator MvaT  47.93 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56070  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  50 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0979321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3313  H-NS family protein MvaT  43.7 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.724808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4437  H-NS family protein MvaT  45.45 
 
 		 125 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00708385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1006  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  46.34 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000105934  hitchhiker  0.0000000000004027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2138  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  43.8 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000737433  hitchhiker  0.00000269456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4448  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  46.34 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000222895  hitchhiker  0.00000983981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4315  transcriptional regulator, putative  43.44 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000286205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4019  transcriptional regulator, putative  43.44 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000000036562  normal  0.0246266 
 
 
 
NC_010501  PputW619_2345  hypothetical protein  45.83 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4357  hypothetical protein  45.53 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.00000000000135149  normal  0.0272701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1366  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  45.53 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000478135  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3765  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  42.5 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148956  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4755  hypothetical protein  43.55 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2921  H-NS family protein MvaT  40.34 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0220889  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2102  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  42.15 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.313756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2971  transcriptional regulator, putative  41.67 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0855395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1998  hypothetical protein  41.67 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.989293  hitchhiker  0.000130496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5037  hypothetical protein  40.5 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.038586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4167  hypothetical protein  41.67 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189495  normal  0.273328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1634  hypothetical protein  41.18 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0882393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0128  hypothetical protein  45.08 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0017  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  41.18 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499101  unclonable  0.000000189493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0009  hypothetical protein  41.18 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000754026  normal  0.103636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0009  hypothetical protein  41.18 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3103  transcriptional regulator, putative  40 
 
 		 120 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000951367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0011  hypothetical protein  41.18 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2947  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  41.18 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194319  normal  0.217791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4794  hypothetical protein  37.82 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38310  Transcriptional regulator MvaT  44 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0396822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29590  putative transcriptional regulator  40.5 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.656804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2532  hypothetical protein  40.5 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3693  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  40.98 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.643108  decreased coverage  0.000194447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3014  hypothetical protein  38.4 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2443  hypothetical protein  39.67 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0503835  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0281  hypothetical protein  40.83 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3337  transcriptional regulator, putative  37.1 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2960  hypothetical protein  35.54 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4162  hypothetical protein  59.52 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>