13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2262 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2262  anti sigma-E protein, RseA  100 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54420  anti-sigma factor MucA  31.98 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000351707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4756  anti-sigma factor MucA  31.98 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1068  anti sigma-E protein, RseA  42.86 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1428  anti sigma-E protein, RseA  41.43 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4293  anti sigma-E protein, RseA  41.43 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4379  anti sigma-E protein, RseA  41.43 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4223  sigma factor algU negative regulatory protein MucA  44.9 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3957  anti sigma-E protein RseA, N-terminal:anti sigma-E protein RseA, C-terminal  44.9 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1363  anti sigma-E protein, RseA  38.64 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1468  anti sigma-E protein, RseA  46 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13700  sigma factor algU negative regulatory protein MucA  25.13 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2250  secretion protein HlyD  32.56 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471731  normal  0.0806236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>