More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1905 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1506  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00711463  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0155651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 281 aa  129  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.320524  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  32.85 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.370306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48977  predicted protein  28.74 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.521571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0156103  normal  0.420839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4328  short chain dehydrogenase protein  36.76 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  31.52 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2147  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.16 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.760058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 247 aa  98.6  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  31.52 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.47 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1892  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0109425  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2840  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 		 302 aa  96.3  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  34.25 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  33.79 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  33.79 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  33.79 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 240 aa  95.9  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 274 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 274 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  33.79 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 318 aa  95.5  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0517  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.84 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.7 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0281  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  36.6 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2034  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  33.79 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  33.79 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  33.79 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2026  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.71 
 
 		 227 aa  93.2  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.293852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00796111  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  33.79 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  33.79 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 246 aa  92.8  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 245 aa  92.4  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.05 
 
 		 238 aa  92.4  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.69 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0894  hypothetical protein  28.81 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.12 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.49 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0147  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.45 
 
 		 451 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  decreased coverage  0.0000299289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0863  hypothetical protein  29.22 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 588 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.66 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.113929  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.66 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15900  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.39 
 
 		 241 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.166031  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 588 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  37.04 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0877268  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.367974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 588 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0655  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.11 
 
 		 450 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>