More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0547 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0547  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 268 aa  558  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3205  exodeoxyribonuclease III  43.28 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0618  exodeoxyribonuclease III Xth  46.24 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000157128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4384  exodeoxyribonuclease III Xth  42.59 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465503  normal  0.053083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6108  catabolite repression control protein  41.57 
 
 		 259 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70390  catabolite repression control protein  41.57 
 
 		 259 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5545  exodeoxyribonuclease III xth  41.06 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0180  exodeoxyribonuclease III Xth  41.06 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  hitchhiker  0.00000710685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02870  catabolite repression control protein; Crc  41.44 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0079  exodeoxyribonuclease III, putative  41.06 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  41.67 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0215  exodeoxyribonuclease III xth  40.68 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5341  exodeoxyribonuclease III Xth  40.3 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11599  hitchhiker  0.00893933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5292  exodeoxyribonuclease III Xth  40.3 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.328538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5200  exodeoxyribonuclease III Xth  40.3 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  36.84 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  37.22 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3671  histidine kinase  38.72 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.148225 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  36.6 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.6 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  36.6 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  36.5 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  35.96 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  36.5 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  36.88 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  36.88 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  38.2 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  38.2 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  35.74 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  35.58 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  35.36 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.98 
 
 		 259 aa  194  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  34.33 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.47 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  37.59 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  36.64 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  35.36 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  35.36 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  35.36 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  35.36 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  35.36 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  35.36 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  35.36 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  36.57 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  34.96 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  36.5 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  36.5 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  35.36 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  32.46 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  33.96 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  34.6 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  32.96 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.33 
 
 		 257 aa  175  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02934  exodeoxyribonuclease III  34.43 
 
 		 266 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  32.22 
 
 		 263 aa  168  8e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  33.7 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.82 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  31.14 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0288  exodeoxyribonuclease III Xth  31.64 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  30.07 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1541  AP endonuclease  30.88 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241112  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  30.07 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  30.27 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  30.55 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  32.45 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  30.27 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  29.62 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  31.94 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  29.56 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  30.18 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0121  exodeoxyribonuclease III Xth  30.04 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00155792  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2193  exodeoxyribonuclease III Xth  32 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.000239022 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  28.52 
 
 		 255 aa  143  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  29.5 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0138  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.3 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.287048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  29.43 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  29.46 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1619  exodeoxyribonuclease III Xth  31.27 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  30.45 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0167  exodeoxyribonuclease III Xth  26.15 
 
 		 319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  28.14 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  28.68 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  27.91 
 
 		 249 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0089  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.15 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  28.79 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  28.78 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  29.63 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000488572 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  27.69 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  28.57 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  32.33 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  28.36 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  30.22 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  28.9 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05100  exodeoxyribonuclease III  29.2 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  29.77 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  30.3 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  29.12 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  29.12 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  29 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  29.01 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>