94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0729 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0729  ABC transporter permease protein p69  100 
 
 
582 aa  1137    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf103  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  31.49 
 
 
565 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000304747  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl571  phosphonate ABC transporter permease component  27.7 
 
 
871 aa  84  0.000000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.720919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1450  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.45 
 
 
273 aa  77  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.126194  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0827  alkylphosphonate ABC transporter, permease protein  27.4 
 
 
911 aa  76.3  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0384777  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0336  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  25.13 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.07 
 
 
264 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  18.68 
 
 
511 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  24.07 
 
 
264 aa  60.1  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.07 
 
 
264 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2337  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.87 
 
 
268 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000326587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  23.61 
 
 
264 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  23.61 
 
 
264 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  23.61 
 
 
264 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  21.99 
 
 
271 aa  57.4  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.07 
 
 
264 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2675  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  22.99 
 
 
297 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0563966 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0131  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  26.32 
 
 
289 aa  56.6  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0113761  hitchhiker  0.00000772966 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  23.15 
 
 
264 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  25.68 
 
 
264 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1451  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.32 
 
 
269 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.11 
 
 
294 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.89 
 
 
272 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.68 
 
 
264 aa  54.7  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.68 
 
 
265 aa  54.7  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  27.18 
 
 
267 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.24 
 
 
267 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1523  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.14 
 
 
267 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137606  normal  0.0137345 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3743  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.24 
 
 
267 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000033324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3370  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.67 
 
 
267 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  24.24 
 
 
267 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  24.24 
 
 
267 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  24.24 
 
 
267 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  25.88 
 
 
266 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  24.24 
 
 
267 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3720  phosphonate ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 
267 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0181873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  19.69 
 
 
275 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  18.35 
 
 
533 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.21 
 
 
279 aa  51.6  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  24.85 
 
 
293 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2876  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.88 
 
 
286 aa  50.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0337  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  23.84 
 
 
269 aa  51.2  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.68 
 
 
290 aa  50.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1343  phosphonate ABC transporter permease  24.88 
 
 
286 aa  50.4  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0495626 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2797  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.88 
 
 
286 aa  50.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0150  oligopeptide ABC transporter, permease protein  23.86 
 
 
343 aa  50.4  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.66 
 
 
272 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.12 
 
 
275 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0132  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  26.47 
 
 
270 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.320501  hitchhiker  0.0000582729 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2283  phosphonate ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
271 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0131  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.37 
 
 
271 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0126  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.37 
 
 
271 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0896  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  22.11 
 
 
295 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.78 
 
 
266 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.78 
 
 
266 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  19.88 
 
 
266 aa  48.5  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.64 
 
 
293 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  19.88 
 
 
266 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4785  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.32 
 
 
280 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161487  normal  0.0587654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0177  phosphonate ABC transporter permease  26.85 
 
 
264 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000132377  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0873  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  21.94 
 
 
265 aa  48.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.81 
 
 
277 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.81 
 
 
277 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  21.95 
 
 
275 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  21.24 
 
 
276 aa  47.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  20.69 
 
 
276 aa  47.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.23 
 
 
294 aa  47.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  18.18 
 
 
276 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  18.18 
 
 
276 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3693  ABC phosphonate transporter inner membrane protein  23.18 
 
 
335 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0926  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  31.13 
 
 
271 aa  47  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000301114  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  18.37 
 
 
266 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  22.54 
 
 
261 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  22.54 
 
 
261 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.87 
 
 
294 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  18.18 
 
 
276 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.83 
 
 
341 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.83 
 
 
341 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  22.93 
 
 
284 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  22.73 
 
 
255 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  22.73 
 
 
255 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  22.56 
 
 
523 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  22.73 
 
 
255 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  22.55 
 
 
293 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2012  putative ABC transporter inner membrane component  22.5 
 
 
271 aa  44.3  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100736  decreased coverage  0.00339933 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2681  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  21.18 
 
 
288 aa  44.3  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.44 
 
 
282 aa  43.9  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.53 
 
 
294 aa  43.9  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  21.55 
 
 
293 aa  43.9  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2368  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  22.56 
 
 
277 aa  43.9  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.97 
 
 
521 aa  43.9  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.56 
 
 
523 aa  43.5  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  21.95 
 
 
431 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  23.22 
 
 
335 aa  43.9  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>