80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0509 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0509  peptidase C39 family protein  100 
 
 
629 aa  1184    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00292307  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl264  putative multidrug ABC transporter  34.41 
 
 
608 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.04334e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  25.79 
 
 
908 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  25.86 
 
 
714 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  24.14 
 
 
723 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  27.92 
 
 
696 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.73 
 
 
738 aa  64.7  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  23.56 
 
 
723 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  23.56 
 
 
723 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  21.25 
 
 
733 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  29.53 
 
 
716 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  23.36 
 
 
743 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.08 
 
 
770 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  25.29 
 
 
724 aa  59.7  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  27.03 
 
 
753 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  27.03 
 
 
772 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  24.21 
 
 
1011 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  27.4 
 
 
753 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  27.03 
 
 
753 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  27.03 
 
 
753 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  27.03 
 
 
753 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  30.37 
 
 
760 aa  57.8  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.03 
 
 
753 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  24.39 
 
 
906 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  24.39 
 
 
906 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0021  sublancin 168 processing and transport ATP-binding protein  24.92 
 
 
701 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  25.6 
 
 
1013 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.45 
 
 
908 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  22.7 
 
 
734 aa  55.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  22.7 
 
 
734 aa  54.7  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  29.61 
 
 
695 aa  54.3  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  23.11 
 
 
727 aa  54.3  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  27.78 
 
 
739 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  25 
 
 
719 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  22.99 
 
 
712 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  28.68 
 
 
726 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  27.07 
 
 
739 aa  53.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  22.47 
 
 
711 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  24.44 
 
 
719 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf637  bacteriocin exporter and processing endoprotease C39  23.6 
 
 
675 aa  52  0.00004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.66238  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  25.58 
 
 
726 aa  52  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  27.78 
 
 
699 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  27.69 
 
 
723 aa  51.2  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
1038 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  22.17 
 
 
715 aa  51.2  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  27.69 
 
 
723 aa  51.2  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0592  ABC Transporter  28.44 
 
 
656 aa  50.8  0.00008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.187972  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  25.33 
 
 
707 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  23.67 
 
 
725 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.81 
 
 
1019 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  20.37 
 
 
706 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  21.73 
 
 
721 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
1038 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  20.37 
 
 
706 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  20.37 
 
 
706 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  24.67 
 
 
727 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  20.37 
 
 
706 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  24.48 
 
 
716 aa  48.5  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  20.81 
 
 
728 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.05 
 
 
707 aa  47.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.05 
 
 
707 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.05 
 
 
707 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.05 
 
 
707 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  27.01 
 
 
1717 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  22.05 
 
 
707 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  25.29 
 
 
704 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.05 
 
 
707 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0732  ABC bacteriocin/lantibiotic exporter, fused ATPase inner membrane and peptidase subunits  21.26 
 
 
705 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.05 
 
 
707 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  20.4 
 
 
695 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  25 
 
 
717 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  26.15 
 
 
704 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.15 
 
 
704 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  22.92 
 
 
719 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  25.68 
 
 
722 aa  45.4  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  24.11 
 
 
714 aa  45.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  22.32 
 
 
1042 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  23.93 
 
 
748 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  25 
 
 
521 aa  44.3  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  22.32 
 
 
735 aa  43.9  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>