68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0417 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0417  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  291  2e-78  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.787062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2429  hypothetical protein  24.5 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1197  hypothetical protein  29.61 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0037  hypothetical protein  32 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.593227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0503  hypothetical protein  29.93 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4091  hypothetical protein  28.99 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224729 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0479  hypothetical protein  28.21 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3867  YiaL  27.45 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3883  YiaL  27.45 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3992  hypothetical protein  27.45 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361661  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4054  hypothetical protein  27.45 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60662  normal  0.509772 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3947  hypothetical protein  27.45 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3353  hypothetical protein  28.17 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970334 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0950  hypothetical protein  24 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.757542  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0180  hypothetical protein  26 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0177  hypothetical protein  25.33 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03379  hypothetical protein  26.32 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0138  hypothetical protein  26.32 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03428  hypothetical protein  26.32 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4077  hypothetical protein  27.08 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3541  hypothetical protein  26.14 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.205481  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0569  hypothetical protein  26.9 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0414  hypothetical protein  25.49 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1492  hypothetical protein  30.32 
 
 
159 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78533 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0134  conserved hypothetical protein  25.66 
 
 
155 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0893  hypothetical protein  26.97 
 
 
156 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0251499  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0942  hypothetical protein  29.03 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0697  hypothetical protein  28.69 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000264124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4189  hypothetical protein  27.45 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3716  hypothetical protein  24.84 
 
 
153 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3899  hypothetical protein  26.32 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1971  hypothetical protein  25.58 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.438499  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1811  hypothetical protein  25.33 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0805666  normal  0.0386938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4073  hypothetical protein  25.66 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3780  hypothetical protein  26.87 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3712  hypothetical protein  29.75 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4126  hypothetical protein  28.99 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1482  hypothetical protein  23.23 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3560  hypothetical protein  26.28 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0455  hypothetical protein  25.49 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.210812  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0441  hypothetical protein  25.49 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3885  hypothetical protein  25.49 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25824  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4507  hypothetical protein  26.62 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0631988  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3745  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0429  hypothetical protein  25.49 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240308  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4823  hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3761  hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.790206  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0453  hypothetical protein  26.32 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5773  hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4753  putative cytoplasmic protein  25 
 
 
150 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0546  hypothetical protein  25.52 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4723  putative cytoplasmic protein  25 
 
 
150 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.229528 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0516  hypothetical protein  27.74 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04082  hypothetical protein  26.62 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3541  hypothetical protein  29.81 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.165984  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0251  hypothetical protein  25.33 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04118  hypothetical protein  26.62 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4871  hypothetical protein  25 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.367962  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4833  hypothetical protein  26.62 
 
 
150 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1574  hypothetical protein  22.66 
 
 
155 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1802  hypothetical protein  22.66 
 
 
155 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.149965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1468  hypothetical protein  22.66 
 
 
155 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2772  hypothetical protein  22.52 
 
 
156 aa  41.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000928029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4816  putative cytoplasmic protein  25 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1405  hypothetical protein  22.52 
 
 
156 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4732  hypothetical protein  26.62 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.750065  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4852  hypothetical protein  24.34 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2157  hypothetical protein  26.45 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.443534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>