111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0078 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0078  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl109  F0F1 ATP synthase subunit A  51.6 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0153  F0F1 ATP synthase subunit A  29.18 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.909475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  29.2 
 
 
247 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf041  F0F1 ATP synthase subunit A  27.82 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  25.39 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  25.2 
 
 
216 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  29.17 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  24.65 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  24.26 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  30.23 
 
 
234 aa  58.9  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  26.23 
 
 
207 aa  57  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  22.47 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  24.2 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  26.15 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  21.35 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  24.68 
 
 
218 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  30.46 
 
 
364 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  26.55 
 
 
241 aa  53.1  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  21.2 
 
 
239 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  22.84 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  22.84 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  22.71 
 
 
246 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  27.4 
 
 
229 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  27.48 
 
 
271 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  26.29 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  23.85 
 
 
230 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  24.44 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  22.22 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  23.46 
 
 
229 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  27.49 
 
 
373 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  28.68 
 
 
233 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  26.15 
 
 
225 aa  48.9  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  23.85 
 
 
229 aa  49.3  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2145  F0F1 ATP synthase subunit A  21.79 
 
 
242 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2183  F0F1 ATP synthase subunit A  21.79 
 
 
242 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.22629  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  26.98 
 
 
234 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  27.38 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  25 
 
 
226 aa  48.9  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  27.62 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  27.82 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_497  ATP synthase F0, A subunit  24.87 
 
 
314 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0558  ATP synthase F0, A subunit  24.34 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000487089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  23.2 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  22.4 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  21.29 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  24.84 
 
 
261 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  28.7 
 
 
253 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  26.42 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  21.67 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  24.55 
 
 
243 aa  47  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3882  F0F1 ATP synthase subunit A  20.9 
 
 
251 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  21.54 
 
 
229 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3956  F0F1 ATP synthase subunit A  20.9 
 
 
251 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0660881 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  21.67 
 
 
261 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3868  F0F1 ATP synthase subunit A  20.9 
 
 
251 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  0.0791726 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  25.31 
 
 
251 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  31.53 
 
 
225 aa  47  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  26.77 
 
 
257 aa  47  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  22.4 
 
 
231 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  25.58 
 
 
194 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  26.22 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1430  F0F1 ATP synthase subunit A  23.81 
 
 
226 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00694031  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  25 
 
 
261 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  25.97 
 
 
241 aa  46.2  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  28.4 
 
 
243 aa  46.2  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0532  ATP synthase F0, A subunit  23.56 
 
 
314 aa  46.2  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000978517  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  22.03 
 
 
227 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  23.87 
 
 
233 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  23.88 
 
 
234 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  22.03 
 
 
227 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  25.62 
 
 
257 aa  45.8  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  25.31 
 
 
251 aa  45.8  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  23.96 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  24 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  23.96 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  24.55 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  27.78 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  27.78 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1938  F0F1 ATP synthase subunit A  34.21 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00021369  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  24.2 
 
 
233 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  30.36 
 
 
227 aa  45.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  27.65 
 
 
373 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  22.75 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  27.78 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  25.2 
 
 
224 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  26.23 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1031  ATP synthase F0, A subunit  23.69 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  20.99 
 
 
246 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  23.6 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  25.78 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  22.31 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  26.17 
 
 
223 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  24.12 
 
 
342 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  22.5 
 
 
262 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4066  ATP synthase F0, A subunit  26.25 
 
 
309 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000333468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  24.28 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3987  ATP synthase F0, A subunit  25.86 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  23.46 
 
 
234 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  21.77 
 
 
236 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>