174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0031 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0031  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator , putative  100 
 
 		 265 aa  522  1e-147  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.89127  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4899  RpiR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 287 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2838  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.91 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2815  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2950  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2734  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3048  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.8 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0550  RpiR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  22.14 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3071  transcriptional regulator, RpiR family  25.57 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  24.37 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1142  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.21 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1248  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.21 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3618  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.21 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.88 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1116  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.83 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02455  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.83 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1107  transcriptional regulator, RpiR family  23.83 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.379447  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2926  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.83 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02419  hypothetical protein  23.83 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3796  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.83 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.83 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.83 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2846  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.83 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.632746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4303  transcriptional regulator, RpiR family  19.89 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  19.78 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0640  transcriptional regulator, RpiR family  17.43 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.360416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  22.8 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1854  RpiR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 380 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1556  putative transcription regulation repressor HEXR transcription regulator protein  20.96 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4864  transcriptional regulator, RpiR family  20.5 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3787  transcriptional regulator, RpiR family  20.5 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.925929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1348  transcriptional regulator, RpiR family  21.63 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1528  transcriptional regulator, RpiR family  22.13 
 
 		 320 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  20.25 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  23.02 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4653  RpiR family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.562293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  23.55 
 
 		 282 aa  52.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0178  RpiR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 291 aa  52  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0183  helix-turn-helix protein RpiR  22.92 
 
 		 291 aa  52  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1901  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  24.8 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0550  transcriptional regulator  23.35 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00967802  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0456  transcriptional regulator, RpiR family  24.7 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2045  putative transcriptional regulator, RpiR family  21.46 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2468  RpiR family transcriptional regulator  18.1 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2247  transcriptional regulator  22.83 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2041  DNA-binding transcriptional regulator HexR  20.61 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2101  DNA-binding transcriptional regulator HexR  20.61 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.928102 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  23.96 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1962  transcriptional regulator, RpiR family  23.08 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2046  DNA-binding transcriptional regulator HexR  20.61 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1361  DNA-binding transcriptional regulator HexR  20.61 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  hitchhiker  0.000131827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1237  DNA-binding transcriptional regulator HexR  20.61 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.101978  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1970  RpiR family transcriptional regulator  19.19 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3272  RpiR family transcriptional regulator  18.15 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.854433  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0972  transcriptional regulator, RpiR family  38.03 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3022  transcriptional regulator, RpiR family  20 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2674  transcriptional regulator, RpiR family  16.78 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0539121 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  21.2 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  19.56 
 
 		 327 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0365  RpiR family transcriptional regulator  17.97 
 
 		 297 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  21.2 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  24.38 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  22.13 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2805  transcriptional regulator, RpiR family  18.41 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531351  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0338  transcriptional regulator, RpiR family  21.26 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4651  RpiR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0360971  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4516  transcriptional regulator, RpiR family  21.43 
 
 		 322 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1330  RpiR family transcriptional regulator  17.91 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  24.18 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27270  DNA-binding transcriptional regulator HexR  16.42 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1589  RpiR family transcriptional regulator  20.24 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  35.29 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  27.75 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0151  transcriptional regulator, RpiR family  19.8 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2643  SIS domain-containing protein  19.9 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574546  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3036  RpiR family transcriptional regulator  18.06 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4059  RpiR family transcriptional regulator  18 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682861  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1596  RpiR family transcriptional regulator  17.91 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  23.7 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  19.47 
 
 		 320 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5679  transcriptional regulator, RpiR family  22.16 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3662  transcriptional regulator, RpiR family  25.1 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.078396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2094  transcriptional regulator, RpiR family  24.52 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  18.5 
 
 		 616 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2769  DNA-binding transcriptional regulator HexR  20.73 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.00789418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2336  DNA-binding transcriptional regulator HexR  21.2 
 
 		 284 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.760972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  24 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3501  transcriptional regulator, RpiR family  20.4 
 
 		 302 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.671277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0969  DNA-binding transcriptional regulator HexR  20.56 
 
 		 284 aa  45.8  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1541  transcriptional regulator  24.09 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2135  DNA-binding transcriptional regulator HexR  21.95 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2023  DNA-binding transcriptional regulator HexR  21.95 
 
 		 289 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.197371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2413  DNA-binding transcriptional regulator HexR  21.95 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000012699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>