173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2029 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2029  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  503  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  28.27 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  31.79 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  29.13 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  32.58 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  38.2 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1664  methyl-transferase  33.16 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  38.2 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  32.02 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  32.02 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  31.46 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  31.46 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  31.46 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  31.46 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  31.46 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  31.46 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  31.46 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  31.46 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  31.85 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  29.18 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1107  methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2684  hypothetical protein  30.5 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1053  putative methyltransferase  30.5 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.600444  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  46.03 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0287  putative methyltransferase  30.82 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  38.2 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0292  putative methyltransferase  30.82 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0300  putative methyltransferase  30.82 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0306  putative methyltransferase  30.82 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0922381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0285  putative methyltransferase  30.82 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  29.82 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3395  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0228  putative methyltransferase  30.82 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0217  putative methyltransferase  30.82 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00136304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00206  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.82 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  27.89 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0226  putative methyltransferase  30.82 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.306208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1535  methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3452  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.607443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00211  hypothetical protein  30.82 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0220  putative methyltransferase  30.82 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.960094  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0210  putative methyltransferase  30.82 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1830  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  26.47 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  29.94 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.79 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  29.22 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03212  hypothetical protein  27.89 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0747  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.955559  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002771  SAM-dependent methyltransferase  27.89 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1008  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.30893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  39.19 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0927  hypothetical protein  24.2 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2400  hypothetical protein  26.28 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3137  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  25.84 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2528  hypothetical protein  48.98 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2840  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1142  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.26 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  25.28 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1896  hypothetical protein  26.42 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  29.63 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1883  hypothetical protein  29.81 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0021884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.81 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  28.29 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1997  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00149539  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2326  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175678  decreased coverage  0.0000300845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2012  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000922882  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2060  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000118598  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1990  hypothetical protein  26 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000251541  hitchhiker  0.00000167474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2610  hypothetical protein  24.49 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000632095  normal  0.867129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  28.37 
 
 		 273 aa  48.9  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1777  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  23.27 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  27.16 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  43.64 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2160  methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000564941  normal  0.0553209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2237  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000104202  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2206  methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553658  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2368  methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000132187  normal  0.0100279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  28.12 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>