96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1176 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1176  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-N  100 
 
 		 317 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  36.6 
 
 		 755 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.96 
 
 		 737 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.35 
 
 		 731 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  30.36 
 
 		 738 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  31.2 
 
 		 756 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  98.11 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  31.35 
 
 		 726 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  29.66 
 
 		 872 aa  108  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  27.59 
 
 		 779 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  28.21 
 
 		 797 aa  89  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.11 
 
 		 753 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  28.81 
 
 		 790 aa  82.8  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  27.34 
 
 		 713 aa  72.4  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  25.65 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 710 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 730 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 		 748 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  24.57 
 
 		 758 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  27.66 
 
 		 720 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  39.58 
 
 		 750 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 		 710 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.62 
 
 		 743 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  24.05 
 
 		 758 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.53 
 
 		 745 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 		 745 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  25.47 
 
 		 772 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3557  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 710 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4573  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 662 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  34.44 
 
 		 756 aa  59.7  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  25.96 
 
 		 715 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  25.33 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.61 
 
 		 766 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  22.74 
 
 		 737 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.65 
 
 		 804 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  26.96 
 
 		 772 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.26 
 
 		 804 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.47 
 
 		 491 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  24.88 
 
 		 742 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  26.13 
 
 		 753 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24 
 
 		 721 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  25.21 
 
 		 756 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4548  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 554 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 759 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  23.71 
 
 		 469 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.33 
 
 		 720 aa  53.1  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 		 774 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 759 aa  52.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  23.63 
 
 		 770 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  23.87 
 
 		 766 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.27 
 
 		 734 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.47 
 
 		 739 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  25.99 
 
 		 773 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  19.82 
 
 		 739 aa  49.7  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  27.97 
 
 		 716 aa  49.7  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3133  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 588 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  23.73 
 
 		 771 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.71 
 
 		 806 aa  49.3  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  25.49 
 
 		 769 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  23.91 
 
 		 789 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6432  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 734 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 750 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  27.15 
 
 		 782 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 726 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.77 
 
 		 756 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  25.87 
 
 		 763 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  31.76 
 
 		 710 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  21.72 
 
 		 727 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  28.24 
 
 		 461 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1073  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.04 
 
 		 728 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649181  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.48 
 
 		 779 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 784 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  28.43 
 
 		 721 aa  46.6  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 588 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  21.65 
 
 		 736 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  26.16 
 
 		 802 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  28.41 
 
 		 759 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 724 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  21.36 
 
 		 738 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  22.11 
 
 		 721 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  27.64 
 
 		 733 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.04 
 
 		 720 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  21.09 
 
 		 724 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  23.23 
 
 		 783 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.25 
 
 		 701 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  20.62 
 
 		 776 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  25.56 
 
 		 734 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 704 aa  43.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  25.18 
 
 		 247 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  22.86 
 
 		 741 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  18.87 
 
 		 723 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  25.24 
 
 		 687 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  22.19 
 
 		 741 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 735 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  29.63 
 
 		 751 aa  42.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>