More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1072 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1072  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  100 
 
 
459 aa  904    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.335242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0599  phosphate ABC transporter permease  66.15 
 
 
465 aa  559  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.070485  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1232  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  64.25 
 
 
462 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.68269  normal  0.54486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3754  phosphate ABC transporter, permease protein  61.94 
 
 
465 aa  537  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3317  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.75 
 
 
464 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3628  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  63.42 
 
 
462 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0395  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.61 
 
 
459 aa  517  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2408  ABC phosphate transporter inner membrane protein, PstC-like protein  58.85 
 
 
468 aa  497  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  57.24 
 
 
460 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  61.68 
 
 
566 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414974  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2277  phosphate ABC transporter permease  55.14 
 
 
460 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1534  phosphate transport system permease protein  48.78 
 
 
489 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.718662  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1920  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.37 
 
 
480 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.71778  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0169  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.29 
 
 
493 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0825  phosphate ABC transporter permease  56.69 
 
 
458 aa  421  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0150658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0179  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.69 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4550  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.86 
 
 
480 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2290  phosphate ABC transporter permease  49.37 
 
 
483 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.33 
 
 
456 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.72 
 
 
481 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.85 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0493  phosphate ABC transporter permease protein  45.97 
 
 
495 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2603  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  51.12 
 
 
481 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2139  phosphate ABC transporter, permease protein  46.6 
 
 
496 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0770  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.35 
 
 
497 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0798935  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2054  phosphate ABC transporter, permease protein  46.6 
 
 
496 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0465  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.11 
 
 
410 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.870192  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4329  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  61.22 
 
 
396 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0107359  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1227  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  45.83 
 
 
486 aa  369  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.696312  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1261  phosphate ABC transporter permease  46.79 
 
 
492 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0500  phosphate ABC transporter permease  58.16 
 
 
414 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1477  phosphate ABC transporter permease  54.49 
 
 
418 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1858  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.22 
 
 
418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  56.69 
 
 
414 aa  356  5e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0377  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.04 
 
 
413 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  57.74 
 
 
409 aa  340  5e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.392493  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0145  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50 
 
 
374 aa  286  8e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00254182  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0982  phosphate ABC transporter, permease protein  52.19 
 
 
374 aa  283  5.000000000000001e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72351  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0202  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  49.67 
 
 
302 aa  278  1e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211138  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  48.34 
 
 
295 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0717  phosphate ABC transporter, permease protein PstC, putative  46.64 
 
 
304 aa  269  8e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0643  phosphate ABC transporter, permease protein PstC, putative  46.64 
 
 
304 aa  269  8e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1055  putative phosphate ABC transporter, permease protein PstC  46.31 
 
 
304 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0800  phosphate ABC transporter, permease protein  47.42 
 
 
304 aa  266  8e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3636  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.34 
 
 
304 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.301349  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2443  phosphate ABC transporter permease  50 
 
 
310 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0046  phosphate ABC transporter permease  48.01 
 
 
313 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.47 
 
 
310 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.86 
 
 
314 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.43 
 
 
320 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.88 
 
 
308 aa  246  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1250  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.77 
 
 
306 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.125763  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  44.37 
 
 
320 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0588  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.79 
 
 
319 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.175196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0287  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.75 
 
 
315 aa  244  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0473771  normal  0.154696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3998  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.16 
 
 
321 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1655  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.22 
 
 
311 aa  243  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4156  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.51 
 
 
319 aa  243  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.56 
 
 
307 aa  240  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3563  phosphate ABC transporter permease  43.71 
 
 
311 aa  238  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.46 
 
 
343 aa  237  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4581  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.02 
 
 
313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0331  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.88 
 
 
315 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113685  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  43.64 
 
 
310 aa  229  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.34 
 
 
307 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.56 
 
 
308 aa  226  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1478  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.56 
 
 
308 aa  226  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0682584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1098  phosphate ABC transporter, permease protein  40.46 
 
 
325 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1052  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.4 
 
 
309 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.130457  hitchhiker  0.0000180725 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.2 
 
 
324 aa  225  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.482233  normal  0.348466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1023  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.4 
 
 
309 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0204  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  43.9 
 
 
324 aa  222  9.999999999999999e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00435822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.26 
 
 
315 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0959  phosphate ABC transporter, permease protein  42.35 
 
 
308 aa  221  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  42.05 
 
 
316 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236226 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4404  phosphate ABC transporter, permease protein  42.05 
 
 
316 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4173  phosphate ABC transporter permease  41.7 
 
 
316 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4495  phosphate ABC transporter permease  41.7 
 
 
316 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4124  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.4 
 
 
316 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4011  phosphate ABC transporter, permease  41.7 
 
 
316 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4021  phosphate ABC transporter, permease  41.34 
 
 
316 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4351  phosphate ABC transporter, permease protein  41.7 
 
 
316 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4387  phosphate ABC transporter, permease protein  41.34 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0849  phosphate ABC transporter, permease protein  38.19 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68749  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.33 
 
 
350 aa  206  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0241985  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.16 
 
 
316 aa  205  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.67 
 
 
324 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2359  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.06 
 
 
358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.97 
 
 
291 aa  196  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.97 
 
 
291 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.77 
 
 
290 aa  194  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1792  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.65 
 
 
310 aa  189  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  38.33 
 
 
298 aa  186  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.64 
 
 
291 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  38.82 
 
 
297 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.82 
 
 
297 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.96 
 
 
296 aa  183  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.66 
 
 
297 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  34.08 
 
 
318 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.45 
 
 
292 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>