88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0269 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0269  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  74.73 
 
 		 535 aa  148  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  73.63 
 
 		 547 aa  148  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  79.12 
 
 		 534 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  74.73 
 
 		 537 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  74.73 
 
 		 537 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  75.82 
 
 		 537 aa  142  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  72.53 
 
 		 535 aa  142  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  74.73 
 
 		 544 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  70.83 
 
 		 540 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3715  type I restriction-modification system, M subunit  71.43 
 
 		 547 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  69.23 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2619  type I restriction-modification system, M subunit  44.6 
 
 		 584 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  49.12 
 
 		 554 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  47.37 
 
 		 528 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  36.71 
 
 		 525 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  36.51 
 
 		 510 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  39.13 
 
 		 522 aa  48.9  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  35 
 
 		 525 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  36.27 
 
 		 518 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  36.27 
 
 		 518 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  36.27 
 
 		 518 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  36.27 
 
 		 518 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  36.51 
 
 		 508 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  36.51 
 
 		 523 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  32.86 
 
 		 495 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  37.88 
 
 		 520 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  39.53 
 
 		 847 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  40 
 
 		 808 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2274  type I restriction-modification system DNA methylase  38.16 
 
 		 527 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  39.53 
 
 		 814 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  40.74 
 
 		 541 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  40.74 
 
 		 518 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0443  hypothetical protein  65.62 
 
 		 46 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000000795345  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  35.06 
 
 		 564 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  43.9 
 
 		 540 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  40.74 
 
 		 544 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  43.9 
 
 		 548 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  43.9 
 
 		 543 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2182  type I restriction-modification system, M subunit  44.19 
 
 		 527 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  37.21 
 
 		 809 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  36.92 
 
 		 524 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  40.48 
 
 		 799 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  40.68 
 
 		 816 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2925  N-6 DNA methylase  31.82 
 
 		 680 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  36.07 
 
 		 505 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  40.48 
 
 		 827 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1127  N-6 DNA methylase  37.78 
 
 		 302 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  27.08 
 
 		 814 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  37.88 
 
 		 517 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  47.37 
 
 		 501 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  43.48 
 
 		 587 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  40 
 
 		 549 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  36.17 
 
 		 506 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1499  type I restriction-modification system, M subunit  38 
 
 		 521 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  37.78 
 
 		 523 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  38.1 
 
 		 871 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2421  type I restriction-modification system, M subunit  41.3 
 
 		 526 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  39.22 
 
 		 519 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  34.04 
 
 		 501 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  36.36 
 
 		 515 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  44.74 
 
 		 540 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  32.88 
 
 		 544 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  51.61 
 
 		 501 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  36.36 
 
 		 515 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  38.1 
 
 		 814 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  27.93 
 
 		 874 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  37.5 
 
 		 633 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  35.19 
 
 		 891 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  36.36 
 
 		 523 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1158  type I restriction-modification system, M subunit  32.61 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  43.9 
 
 		 860 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  44.19 
 
 		 574 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  38.1 
 
 		 539 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  44.19 
 
 		 574 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  44.19 
 
 		 574 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 525 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  33.33 
 
 		 525 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  44 
 
 		 517 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4458  type I restriction-modification system, M subunit  38.46 
 
 		 863 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  41.03 
 
 		 810 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  41.67 
 
 		 520 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  34.09 
 
 		 529 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  38.1 
 
 		 799 aa  40  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  34.09 
 
 		 529 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  34.04 
 
 		 499 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  38.46 
 
 		 863 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  38.46 
 
 		 910 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>