174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0031 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0031  ISMca6, transposase, OrfA  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.212668  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1611  ISMca6, transposase, OrfA  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1030  hypothetical protein  54.35 
 
 		 207 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3188  hypothetical protein  54.35 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0815564  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01418  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01430  hypothetical protein  31.11 
 
 		 258 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2196  transposase IS4 family protein  31.67 
 
 		 263 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  32.22 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  31.11 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  32.94 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  31.11 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  31.67 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.893846 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1544  ISEc1, transposase  31.67 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.59802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  31.46 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  31.67 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2949  transposase IS4 family protein  31.67 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.146429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  31.67 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  32.24 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  31.11 
 
 		 378 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  31.11 
 
 		 378 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  31.11 
 
 		 378 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0796  ISEc4, transposase  31.67 
 
 		 378 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.699242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  31.11 
 
 		 378 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  30.9 
 
 		 377 aa  80.9  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5084  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 388 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0282093 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0083  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 388 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0627718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1781  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 388 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0336  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 388 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401127  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3776  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 388 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3914  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 388 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2179  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 388 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01416  hypothetical protein  32.22 
 
 		 248 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01428  hypothetical protein  32.22 
 
 		 248 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0598  transposase, IS4  28.49 
 
 		 374 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2439  transposase, IS4  28.49 
 
 		 374 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2930  transposase IS4 family protein  29.57 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0753  ISEc4, transposase  29.57 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135748  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3009  transposase  30.73 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0477  transposase, IS4  27.96 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1127  transposase, IS4  27.96 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1172  transposase, IS4  27.96 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00666  hypothetical protein  29.03 
 
 		 253 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00655  hypothetical protein  29.03 
 
 		 253 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  32.78 
 
 		 390 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01670  hypothetical protein  31.28 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  29.44 
 
 		 374 aa  68.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  29.44 
 
 		 374 aa  68.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  29.44 
 
 		 374 aa  68.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  32.8 
 
 		 372 aa  68.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  32.95 
 
 		 372 aa  68.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  29.44 
 
 		 374 aa  68.2  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2042  transposase, IS4 family protein  28.89 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  normal  0.19233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  32.39 
 
 		 372 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3482  transposase, IS4 family protein  31.76 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.249116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  32.39 
 
 		 372 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2129  transposase, putative  26.67 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2810  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3073  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 367 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  33.92 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6377  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 395 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5660  transposase ISAs1 family protein  41.67 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315532 
 
 
-
 
NC_002950  PG0277  ISPg2, transposase  28.11 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0865  ISPg2, transposase  28.11 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00233065 
 
 
-
 
NC_002950  PG1350  ISPg2, transposase  28.11 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1746  ISPg2, transposase  28.11 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2176  ISPg2, transposase  28.11 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2797  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2788  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2581  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  29.94 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0119  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0149  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0202  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0303  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0682855  hitchhiker  0.000916008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0309  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0471635  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0738  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0946  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1128  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.588687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1208  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580932  hitchhiker  0.00000329494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1487  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1510  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1512  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1765  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2080  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2131  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0176803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2134  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0202334 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2180  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000540383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2331  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.616307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2395  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2427  hypothetical protein  30.98 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.383044  hitchhiker  0.00036202 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>