More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf449 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf449  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 71 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  49.3 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  50.7 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  46.48 
 
 		 72 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0751  ribosomal protein L31  48.39 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  60.32 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  57.14 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  57.81 
 
 		 73 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  46.48 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  46.48 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0165  ribosomal protein L31  53.97 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  52.38 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  55.56 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  53.97 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  46.77 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  55.56 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  55.56 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  46.77 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03821  50S ribosomal subunit protein L31  52.38 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4049  ribosomal protein L31  52.38 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  41.79 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4419  50S ribosomal protein L31  52.38 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4342  50S ribosomal protein L31  55.56 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  55.56 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4312  50S ribosomal protein L31  55.56 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4472  50S ribosomal protein L31  52.38 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  55.56 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  52.38 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5394  50S ribosomal protein L31  52.38 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.948116  normal  0.943424 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0980  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000192079  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4082  50S ribosomal protein L31  52.38 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4378  50S ribosomal protein L31  52.38 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4168  50S ribosomal protein L31  52.38 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  55.56 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03770  hypothetical protein  52.38 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  43.55 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  50.82 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  51.61 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2003  ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14904  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  45.16 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  53.97 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0118  50S ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  48.39 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  48.39 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0170  50S ribosomal protein L31  53.97 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3811  50S ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  46.77 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4098  50S ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  48.39 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  48.39 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1150  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000442402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4788  50S ribosomal protein L31  52.38 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000702878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4037  50S ribosomal protein L31  50.79 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2693  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000422577  hitchhiker  0.00222297 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  40.32 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  46.77 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  48.39 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  49.18 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  48.39 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  45.16 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  45.16 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2697  ribosomal protein L31  41.18 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000195547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  45.16 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  45.16 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  47.62 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3074  ribosomal protein L31  39.06 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000909466  unclonable  0.0000000191791 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl638  50S ribosomal protein L31  47.54 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  46.03 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  46.03 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  47.62 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  45.31 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1806  50S ribosomal protein L31  45.16 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000545345  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  38.71 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1165  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000036585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  43.55 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  46.03 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  41.18 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>