More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf435 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf435  50S ribosomal protein L16  100 
 
 
150 aa  306  5.9999999999999995e-83  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0233  50S ribosomal protein L16  58.65 
 
 
138 aa  155  2e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1476  50S ribosomal protein L16  62.41 
 
 
144 aa  154  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000158186  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  59.4 
 
 
137 aa  150  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  59.4 
 
 
137 aa  150  8e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl130  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 
137 aa  148  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0689  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 
137 aa  147  5e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2395  50S ribosomal protein L16  58.65 
 
 
137 aa  146  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00185244  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  54.93 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  54.89 
 
 
144 aa  144  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  54.89 
 
 
144 aa  144  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0203  50S ribosomal protein L16  57.89 
 
 
137 aa  144  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  59.4 
 
 
145 aa  143  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0602  50S ribosomal protein L16  55.88 
 
 
143 aa  142  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397194  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  54.14 
 
 
144 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0298  50S ribosomal protein L16  52.52 
 
 
145 aa  141  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.11723e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  52.24 
 
 
140 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 
144 aa  140  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 
144 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  54.14 
 
 
144 aa  140  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  55.22 
 
 
139 aa  139  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  56.62 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  55.97 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  54.14 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  54.14 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  54.14 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 
144 aa  138  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  53.38 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  53.38 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  53.38 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  53.38 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  53.38 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  53.38 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  53.38 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  53.38 
 
 
144 aa  137  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  53.38 
 
 
144 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  55.97 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  50 
 
 
140 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  53.96 
 
 
145 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  52.24 
 
 
140 aa  135  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 
147 aa  135  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  52.63 
 
 
139 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  54.89 
 
 
139 aa  135  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  54.14 
 
 
151 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  50.75 
 
 
141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  52.24 
 
 
140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  53.38 
 
 
144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  53.73 
 
 
144 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  53.73 
 
 
144 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  50 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  50 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  54.48 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  51.88 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  51.49 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2900  ribosomal protein L16  52.63 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  48.87 
 
 
142 aa  131  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  47.76 
 
 
140 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  47.14 
 
 
139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  47.14 
 
 
139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1278  ribosomal protein L16  52.63 
 
 
140 aa  130  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  47.76 
 
 
140 aa  130  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  47.76 
 
 
140 aa  130  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  52.63 
 
 
151 aa  130  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  53.38 
 
 
137 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3988  ribosomal protein L16  50.38 
 
 
141 aa  130  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  47.01 
 
 
140 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  51.49 
 
 
139 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  52.21 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  52.99 
 
 
137 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  48.12 
 
 
140 aa  129  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  47.97 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2169  50S ribosomal protein L16  51.88 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2225  50S ribosomal protein L16  51.49 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2130  50S ribosomal protein L16  51.88 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.517318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2447  50S ribosomal protein L16  51.88 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  53.73 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  52.24 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  51.11 
 
 
142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4350  50S ribosomal protein L16  49.25 
 
 
142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215077  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  51.49 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  51.13 
 
 
144 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  50 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1931  50S ribosomal protein L16  50 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1411  50S ribosomal protein L16  48.51 
 
 
136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  48.87 
 
 
138 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  48.15 
 
 
140 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  49.62 
 
 
143 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  45.52 
 
 
140 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  47.01 
 
 
142 aa  126  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  46.27 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1621  50S ribosomal protein L16  50.37 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339753  normal  0.316448 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  52.24 
 
 
141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  49.25 
 
 
138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  51.13 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  50 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  51.49 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  52.34 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  50.75 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  48.87 
 
 
137 aa  124  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>