More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf245 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf245  ribosomal protein S16  100 
 
 
85 aa  174  4e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00213273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  56.76 
 
 
135 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  55.41 
 
 
82 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1092  ribosomal protein S16  57.89 
 
 
119 aa  87.8  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000161695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 
195 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  47.67 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  47.67 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  47.67 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  47.67 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  47.67 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  47.67 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  47.67 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  47.67 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  47.67 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  50.63 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  52.7 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  52.7 
 
 
108 aa  84  6e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  46.51 
 
 
90 aa  83.6  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  49.43 
 
 
93 aa  83.6  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  46.51 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
86 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  48.65 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  45.98 
 
 
91 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  45.98 
 
 
91 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14841  30S ribosomal protein S16  53.42 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321531  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  52.7 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2772  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.48934 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13321  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.257146  normal  0.676995 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1381  30S ribosomal protein S16  53.42 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14461  30S ribosomal protein S16  53.42 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4357  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000000929169  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2536  SSU ribosomal protein S16P  52.05 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000571366  decreased coverage  0.00236598 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  45.88 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0883  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738027  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1516  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14701  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 
121 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  43.21 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0852  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  42.35 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17051  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.701921  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1983  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 
82 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  48 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19551  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.669471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1956  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 
82 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0804  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1772  30S ribosomal protein S16  46.75 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  45.68 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1143  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0121256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  48.65 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0665  30S ribosomal protein S16  42.86 
 
 
101 aa  77  0.00000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.0000270999  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  48 
 
 
81 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  48 
 
 
81 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  43.53 
 
 
90 aa  77  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  52 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  50.67 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  47.3 
 
 
81 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 
82 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0117  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  44.71 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  48 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5264  30S ribosomal protein S16  45.12 
 
 
82 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  41.98 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  47.95 
 
 
81 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  43.53 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  48.65 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  44.74 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  46.67 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  45.88 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  41.98 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  45.88 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
85 aa  73.9  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0881  ribosomal protein S16  45.57 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000838528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  48.61 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  50.68 
 
 
85 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  51.39 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3276  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256511  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39161  Putative mitochondrial ribosomal protein S16  45.45 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2483  ribosomal protein S16  47.22 
 
 
86 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.0960176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  50.68 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  48 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  43.21 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  44.59 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  44.59 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>