37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf127 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf127  recombinational DNA repair protein O  100 
 
 
220 aa  442  1e-123  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  23.36 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  26.26 
 
 
270 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  29.47 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  26.06 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  24.16 
 
 
300 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  22.11 
 
 
258 aa  48.5  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  22.73 
 
 
243 aa  48.5  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  23.63 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  24.88 
 
 
248 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  21.18 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  24.88 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  24.88 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  24.88 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  24.88 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  24.88 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  24.88 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  24.88 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  24 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  24.88 
 
 
248 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  21.51 
 
 
250 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  24.86 
 
 
248 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  23.88 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  27.37 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  22.95 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  39.66 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  28.11 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  21.98 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  22.28 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0506  DNA repair protein RecO  32.1 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00293649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  23.22 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  22.1 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0563  DNA repair protein RecO  23.24 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.282458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  23.47 
 
 
256 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  22.16 
 
 
244 aa  42.4  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  23.5 
 
 
248 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  24 
 
 
250 aa  41.6  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>