More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf112 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf112  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
324 aa  657    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.83 
 
 
315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.16 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.47 
 
 
325 aa  266  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0183  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.75 
 
 
331 aa  265  8e-70  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  43.81 
 
 
326 aa  264  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.32 
 
 
313 aa  262  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.48 
 
 
318 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl076  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  44.98 
 
 
347 aa  260  2e-68  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.687526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.97 
 
 
316 aa  255  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.67 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.97 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.11 
 
 
330 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  44.48 
 
 
327 aa  252  5.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3557  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.19 
 
 
314 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00334731  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0759  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.71 
 
 
310 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.64 
 
 
314 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.77 
 
 
315 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.69 
 
 
317 aa  249  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.03 
 
 
316 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.44 
 
 
316 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 
316 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.27 
 
 
318 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.61 
 
 
315 aa  246  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0104  phosphoribosylpyrophosphate synthase  43.52 
 
 
344 aa  246  3e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.75 
 
 
317 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.08 
 
 
317 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.08 
 
 
317 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.08 
 
 
317 aa  246  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.08 
 
 
317 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.08 
 
 
317 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.08 
 
 
317 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.08 
 
 
317 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.08 
 
 
317 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.08 
 
 
317 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.42 
 
 
317 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.52 
 
 
314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
319 aa  245  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.72 
 
 
315 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.58 
 
 
332 aa  245  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.26 
 
 
311 aa  245  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.35 
 
 
315 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.18 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.57 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.33 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0671  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.81 
 
 
312 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.94 
 
 
314 aa  243  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.75 
 
 
308 aa  243  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.18 
 
 
309 aa  243  3e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.36 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0160  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  42.5 
 
 
336 aa  243  5e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.56 
 
 
337 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3130  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.63 
 
 
324 aa  242  7e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268526  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.52 
 
 
309 aa  241  9e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.67 
 
 
315 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3463  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.63 
 
 
315 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal  0.770216 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1453  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.24 
 
 
316 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.28 
 
 
336 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.99 
 
 
324 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000010971  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.2 
 
 
324 aa  241  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.94 
 
 
338 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.72 
 
 
314 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.94 
 
 
338 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.62 
 
 
331 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.81 
 
 
314 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.59 
 
 
315 aa  241  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.18 
 
 
331 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.31 
 
 
324 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.48 
 
 
316 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.48 
 
 
316 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  43.14 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.99 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.31 
 
 
315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.81 
 
 
314 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.04 
 
 
314 aa  239  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.19 
 
 
331 aa  239  5e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.06 
 
 
318 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.06 
 
 
318 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.99 
 
 
315 aa  239  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.97 
 
 
315 aa  239  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127042  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.13 
 
 
331 aa  239  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.37 
 
 
317 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.56 
 
 
329 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.36 
 
 
329 aa  238  8e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.97 
 
 
315 aa  238  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.67 
 
 
315 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.67 
 
 
315 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.67 
 
 
315 aa  238  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.65 
 
 
315 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40 
 
 
310 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.65 
 
 
315 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.91 
 
 
331 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  40.65 
 
 
315 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.69 
 
 
325 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.65 
 
 
315 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.36 
 
 
327 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.65 
 
 
315 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.65 
 
 
315 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.97 
 
 
315 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.44 
 
 
323 aa  237  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>