81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02560 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02560  cyanate hydratase  100 
 
 
91 aa  184  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2824  cyanate hydratase  63.95 
 
 
149 aa  120  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0220  cyanate hydratase  60.47 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0994  cyanate hydratase  65.85 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0467  cyanate hydratase  59.3 
 
 
149 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1442  cyanate hydratase  62.2 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.905094  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3834  cyanate hydratase  65.85 
 
 
147 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4911  cyanate hydratase  65.85 
 
 
147 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.278178  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3484  cyanate hydratase  60.24 
 
 
147 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1335  cyanate hydratase  57.32 
 
 
147 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3739  cyanate hydratase  59.76 
 
 
147 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0289  cyanate hydratase  56.1 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1941  cyanate hydratase  57.83 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.711654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3478  cyanate hydratase  55.42 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5864  cyanate hydratase  61.43 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.847766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0547  cyanate hydratase  54.88 
 
 
147 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3975  cyanate hydratase  58.54 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0303044 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2169  cyanate hydratase  51.22 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185897  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5946  cyanate hydratase  40.48 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.249052 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5702  cyanate hydratase  40.48 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.174504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4912  cyanate hydratase  41.46 
 
 
149 aa  67  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0013  cyanate hydratase  41.46 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2147  cyanate hydratase  42.68 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1533  cyanate hydratase  42.68 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243959  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3389  cyanate hydratase  38.1 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.532373  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14070  cyanate hydratase  43.53 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.700662  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4127  cyanate hydratase  38.1 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0840214 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4778  cyanate hydratase  38.1 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2755  cyanate hydratase  38.55 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.193973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0717  cyanate hydratase  38.55 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495999  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0731  cyanate hydratase  38.55 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.817256  normal  0.0248217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1198  cyanate hydratase  39.76 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2815  cyanate hydratase  38.1 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3463  cyanate hydratase  40.48 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0711  cyanate hydratase  38.55 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3464  cyanate hydratase  40.48 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2466  cyanate hydratase  41.46 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.773652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0405  cyanate hydratase  36.9 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3321  cyanate hydratase  41.46 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3427  cyanate hydratase  41.46 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1245  cyanate hydratase  41.46 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.267707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0365  cyanate hydratase  36.9 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.255513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0385  cyanate hydratase  41.46 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0413  cyanate hydratase  36.9 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0371  cyanate hydratase  36.9 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3236  cyanate hydratase  35.71 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00298  hypothetical protein  35.71 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3266  cyanate lyase  35.71 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00294  cyanate hydratase  35.71 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1707  cyanate hydratase  42.17 
 
 
162 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0867488  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3092  cyanate hydratase  38.1 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109616  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3369  cyanate hydratase  42.17 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.792126  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3285  cyanate hydratase  34.52 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809741  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4815  cyanate hydratase  40.96 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.194691  decreased coverage  0.000076587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37965  cyanate hydratase  33.33 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000905925  normal  0.0242792 
 
 
-
 
NC_003296  RS02188  cyanate hydratase  64.29 
 
 
99 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4539  cyanate hydratase  39.76 
 
 
162 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2057  cyanate hydratase  42.17 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3483  cyanate hydratase  36.59 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258814  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1930  cyanate lyase  35.71 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.828935  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0040  cyanate hydratase  41.46 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2892  cyanate hydratase  38.55 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2769  cyanate hydratase  38.55 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2827  cyanate lyase  39.29 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2996  cyanate hydratase  38.55 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4859  Cyanase  47.89 
 
 
156 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1631  cyanate hydratase  39.76 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1997  cyanate hydratase  36.47 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2586  cyanate hydratase  34.15 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5412  cyanate hydratase  37.35 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232081  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1302  cyanate hydratase  39.76 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2287  cyanate hydratase  33.33 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3729  cyanate hydratase  36.59 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0961  cyanate lyase  34.88 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.357006 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2659  cyanate hydratase  31.65 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0173685  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0112  cyanate hydratase  35.71 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0702  cyanate hydratase  32.93 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.673515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3239  cyanate hydratase  29.27 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2406  cyanate hydratase  33.73 
 
 
162 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109021  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2104  cyanate hydratase  32.53 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.852615  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00701  cyanate hydratase  30.77 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.454831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>