30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01502 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01502  minor curlin subunit CsgB, putative  100 
 
 		 170 aa  333  5.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  44.21 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  40 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  35.11 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  33.9 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  33.9 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  36.89 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  36.89 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  43.21 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  43.21 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  40.59 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  36.89 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  39.47 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  37.86 
 
 		 392 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  34.09 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  34.11 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  39.53 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  31.4 
 
 		 552 aa  44.3  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  34.88 
 
 		 453 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  33.54 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  36.45 
 
 		 502 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  33.64 
 
 		 627 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  29.03 
 
 		 151 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  29.71 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0926  hypothetical protein  27.5 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0402571  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  29.03 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  29.03 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  29.03 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  40.79 
 
 		 481 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  35.51 
 
 		 502 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>