More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01103 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01103  recombination protein RecR  100 
 
 		 172 aa  352  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2895  recombination protein RecR  73.26 
 
 		 200 aa  275  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3690  recombination protein RecR  65.29 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002887  recombination protein RecR  63.37 
 
 		 172 aa  236  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03085  recombination protein RecR  63.37 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00423  recombination protein RecR  62.79 
 
 		 201 aa  235  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3138  recombination protein RecR  62.79 
 
 		 201 aa  235  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00115483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0515  recombination protein RecR  62.79 
 
 		 201 aa  235  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0104504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3144  recombination protein RecR  62.79 
 
 		 201 aa  235  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000102552  normal  0.0467861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0549  recombination protein RecR  62.79 
 
 		 201 aa  235  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0169902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0510  recombination protein RecR  62.79 
 
 		 201 aa  235  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00333921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0404  recombination protein RecR  62.79 
 
 		 201 aa  235  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00880245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0563  recombination protein RecR  62.79 
 
 		 201 aa  235  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1087  recombination protein RecR  63.37 
 
 		 200 aa  235  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3233  recombination protein RecR  62.79 
 
 		 201 aa  234  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0537  recombination protein RecR  61.63 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1078  recombination protein RecR  62.21 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00501486  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0591  recombination protein RecR  61.63 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0531  recombination protein RecR  61.63 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0547  recombination protein RecR  61.63 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0531  recombination protein RecR  61.63 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.907674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1021  recombination protein RecR  62.21 
 
 		 201 aa  231  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.541462  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0574  recombination protein RecR  62.79 
 
 		 200 aa  231  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000410882  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0952  recombination protein RecR  61.63 
 
 		 201 aa  231  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.051321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2272  recombination protein RecR  61.54 
 
 		 199 aa  230  8.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3037  recombination protein RecR  62.79 
 
 		 201 aa  229  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1308  recombination protein RecR  60.47 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19850  recombination protein RecR  62.21 
 
 		 199 aa  224  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1137  recombination protein RecR  60.36 
 
 		 201 aa  223  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1524  unclonable  0.0000000160552 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2891  recombination protein RecR  60.47 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.860554  normal  0.0804911 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3196  recombination protein RecR  60.47 
 
 		 191 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.49485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3057  recombination protein RecR  60.47 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44610  recombination protein RecR  62.21 
 
 		 198 aa  222  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3799  recombination protein RecR  61.05 
 
 		 198 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1611  recombination protein RecR  61.05 
 
 		 200 aa  219  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2645  recombination protein RecR  60.47 
 
 		 199 aa  215  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1312  recombination protein RecR  59.3 
 
 		 199 aa  214  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000599572  normal  0.10008 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1075  recombination protein RecR  59.65 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1795  recombination protein RecR  58.14 
 
 		 199 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000406464  unclonable  0.00000000671172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4267  recombination protein RecR  60.12 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1337  recombinational DNA repair protein  57.56 
 
 		 197 aa  211  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.43328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2300  recombination protein RecR  58.14 
 
 		 199 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000570864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  60.36 
 
 		 203 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2252  recombination protein RecR  58.72 
 
 		 199 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  normal  0.192346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2324  recombination protein RecR  58.72 
 
 		 199 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000382966  hitchhiker  0.000472846 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1508  recombination protein RecR  57.65 
 
 		 199 aa  211  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0537537  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2444  recombination protein RecR  58.72 
 
 		 199 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000238207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1601  recombination protein RecR  60.12 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.973097  normal  0.137201 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2233  recombination protein RecR  58.14 
 
 		 199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000324315  hitchhiker  0.000184375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1427  recombination protein RecR  59.3 
 
 		 199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2572  recombination protein RecR  58.14 
 
 		 199 aa  210  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000111404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1771  recombination protein RecR  58.14 
 
 		 199 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000264965  hitchhiker  0.0019577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2688  recombination protein RecR  58.14 
 
 		 199 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000959459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2613  recombination protein RecR  58.14 
 
 		 199 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000932221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1537  recombination protein RecR  58.14 
 
 		 199 aa  210  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0998333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2015  recombination protein RecR  58.72 
 
 		 199 aa  209  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1808  recombination protein RecR  58.96 
 
 		 200 aa  209  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3585  recombination protein RecR  58.96 
 
 		 200 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3396  recombination protein RecR  58.96 
 
 		 200 aa  206  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0105717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1525  recombination protein RecR  57.4 
 
 		 199 aa  206  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.3253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3832  recombination protein RecR  58.38 
 
 		 200 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.539989 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1326  recombination protein RecR  57.56 
 
 		 198 aa  204  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.787155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1853  recombination protein RecR  54.97 
 
 		 196 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.38333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2532  recombination protein RecR  57.56 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2595  RecR protein  56.98 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00242938  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  55.29 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02441  recombination protein RecR  55.81 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3638  recombination protein RecR  57.8 
 
 		 200 aa  197  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0531  recombination protein RecR  52.91 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0553702  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0859  recombination protein RecR  56.21 
 
 		 199 aa  197  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2850  recombination protein RecR  59.17 
 
 		 199 aa  195  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000709734  hitchhiker  0.0000000347655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2127  recombination protein RecR  54.55 
 
 		 204 aa  194  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441017  normal  0.634686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1038  recombination protein RecR  53.98 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.413598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2110  recombination protein RecR  53.41 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00315118  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1130  recombination protein RecR  53.41 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0808  recombination protein RecR  54.12 
 
 		 199 aa  191  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000914779  hitchhiker  0.00000103011 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1121  recombination protein RecR  54.44 
 
 		 198 aa  191  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1215  recombination protein RecR  54.44 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2371  recombination protein RecR  51.74 
 
 		 202 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1121  recombination protein RecR  51.74 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1359  recombination protein RecR  51.74 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.604607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0953  recombination protein RecR  50.58 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2242  recombination protein RecR  51.74 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0434311  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1849  recombination protein RecR  51.74 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00281563  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2204  recombination protein RecR  51.74 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0167487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1828  recombination protein RecR  51.74 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.872304  normal  0.176292 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0047  recombination protein RecR  51.74 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.612857  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0509  recombination protein RecR  54.12 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2359  recombination protein RecR  51.16 
 
 		 198 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0253642  normal  0.0767451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1736  recombination protein RecR  51.16 
 
 		 198 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.0799588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1763  recombination protein RecR  51.16 
 
 		 198 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0773  recombination protein RecR  54.71 
 
 		 201 aa  187  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2221  recombination protein RecR  51.74 
 
 		 200 aa  187  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.325098  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0667  recombination protein RecR  54.71 
 
 		 201 aa  187  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2804  recombination protein RecR  50.3 
 
 		 197 aa  187  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2673  recombination protein RecR  50.3 
 
 		 197 aa  187  8e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1448  recombination protein RecR  51.16 
 
 		 198 aa  186  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.672382  normal  0.0921659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1194  recombination protein RecR  55.11 
 
 		 207 aa  186  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.381578  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1849  recombination protein RecR  51.16 
 
 		 198 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41197  normal  0.133584 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1825  recombination protein RecR  51.16 
 
 		 198 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>