29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_R0015 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_R0015  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0069  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.989789  normal  0.0574116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0030  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0060  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0058  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0065  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.522927  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0056  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0062  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0026  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.0153028 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4589  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0824  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0733527  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0029  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.781659  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0058  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA22  tRNA-Lys  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0084  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0022  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134574 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0552  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0066  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0067  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0068  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.437414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0078  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000025771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0081  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0028  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37540  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0863573  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06840  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0011  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>