14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6993 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010373  M446_6993  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  174  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.439949  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1282  hypothetical protein  40.91 
 
 
232 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.147324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1208  Insertion element protein  37.31 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2516  Insertion element protein  37.31 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5203  Insertion element protein  37.31 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32414e-16 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5744  Insertion element protein  37.31 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0043  hypothetical protein  39.34 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000166615  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1752  hypothetical protein  32.31 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3162  hypothetical protein  39.34 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00204659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1324  hypothetical protein  37.7 
 
 
75 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000817472  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1328  hypothetical protein  37.7 
 
 
75 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0044  IS1, transposase orfB  32.35 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3838  IS1 transposase  31.94 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0165  insertion sequence protein  35.94 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000498259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>