70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5542 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5542  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7962  hypothetical protein  88.89 
 
 
90 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.027631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1049  hypothetical protein  87.78 
 
 
90 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2948  hypothetical protein  80 
 
 
93 aa  141  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0084  hypothetical protein  77.53 
 
 
91 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0166  hypothetical protein  76.4 
 
 
91 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2963  hypothetical protein  80 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4248  hypothetical protein  65.96 
 
 
93 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287019  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0077  hypothetical protein  80 
 
 
93 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932951  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2497  hypothetical protein  62.22 
 
 
90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.514422  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1346  hypothetical protein  74.16 
 
 
91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.439397  hitchhiker  0.000296751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3985  hypothetical protein  74.16 
 
 
91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  71.43 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3694  hypothetical protein  50.63 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2034  hypothetical protein  46.75 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.492763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3695  hypothetical protein  43.68 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1620  hypothetical protein  46.05 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3184  hypothetical protein  60 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34429  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0876  hypothetical protein  47.89 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271927  normal  0.154424 
 
 
-
 
NC_002978  WD0557  hypothetical protein  42.31 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0462  hypothetical protein  39.19 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.781265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2680  hypothetical protein  48.86 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212729  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0576  hypothetical protein  38.16 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.191205  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2535  hypothetical protein  41.56 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1740  hypothetical protein  41.56 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1161  hypothetical protein  49.3 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178544  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1480  hypothetical protein  42.11 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1419  hypothetical protein  40.79 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.500406  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0164  hypothetical protein  42.11 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1798  hypothetical protein  42.11 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.320432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0180  hypothetical protein  53.42 
 
 
91 aa  63.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2635  hypothetical protein  43.06 
 
 
94 aa  62  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1042  hypothetical protein  45.76 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.980568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1502  hypothetical protein  44.44 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1734  hypothetical protein  39.47 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3737  hypothetical protein  37.66 
 
 
83 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00728994  normal  0.292015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1313  hypothetical protein  47.62 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.214688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3293  hypothetical protein  44.83 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.587635  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2872  hypothetical protein  55.56 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2750  hypothetical protein  55.56 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.897901  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2977  hypothetical protein  55.56 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734498  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3594  hypothetical protein  44.83 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2078  hypothetical protein  43.06 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3610  hypothetical protein  43.06 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6866  hypothetical protein  51.39 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  0.022304 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0989  hypothetical protein  46.67 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.684189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1659  hypothetical protein  43.06 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178857  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4670  hypothetical protein  45.33 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315448  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3346  hypothetical protein  43.06 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319255  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2443  hypothetical protein  42.11 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2455  conserved hypothetical protein-like protein  44.58 
 
 
280 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167082  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1221  hypothetical protein  46.15 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.661908  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1405  hypothetical protein  48.89 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479596  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3979  hypothetical protein  48.89 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121303  normal  0.274015 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1426  hypothetical protein  48.89 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3227  hypothetical protein  43.24 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5968  hypothetical protein  44.16 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5200  hypothetical protein  44.16 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2066  hypothetical protein  45.95 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576605  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1557  hypothetical protein  32.94 
 
 
206 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1696  hypothetical protein  46.15 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000802562  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0123  hypothetical protein  39.74 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0915  hypothetical protein  42.86 
 
 
91 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3699  hypothetical protein  41.51 
 
 
84 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3367  hypothetical protein  48.89 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1752  hypothetical protein  46.67 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1691  hypothetical protein  44.44 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0430  hypothetical protein  44.44 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1916  hypothetical protein  30.77 
 
 
269 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.863299  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0339  hypothetical protein  44.44 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0341011  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>