More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5139 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5139  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  497  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2683  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  59.53 
 
 		 318 aa  291  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2960  ABC transporter related  56.69 
 
 		 265 aa  281  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3644  ABC transporter related  57.87 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  47.29 
 
 		 578 aa  258  8e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3086  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.38 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2952  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.38 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.59 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2427  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.59 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3041  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.59 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3236  ABC peptide transporter, ATPase subunit  51.75 
 
 		 282 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3973  ABC transporter related  51.75 
 
 		 282 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0224  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.59 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3967  hypothetical protein  52.12 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420932  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.19 
 
 		 338 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.19 
 
 		 338 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  51.19 
 
 		 338 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 609 aa  244  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.27 
 
 		 337 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3305  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 		 338 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2973  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 		 338 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445029  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2117  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 		 338 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3374  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 		 338 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  48.85 
 
 		 593 aa  242  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 		 321 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  48.45 
 
 		 640 aa  241  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  48.65 
 
 		 623 aa  241  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3036  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 338 aa  240  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.64 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  48.65 
 
 		 623 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0333  ABC transporter related  51.15 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 		 623 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.28 
 
 		 336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.21 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  43.31 
 
 		 308 aa  238  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2496  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 		 454 aa  238  5.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.21 
 
 		 339 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.57 
 
 		 703 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2174  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  50 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.837034  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  44.92 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0999  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.61 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0202  hypothetical protein  46.09 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  46.48 
 
 		 583 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0211  hypothetical protein  46.09 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.88 
 
 		 308 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 308 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.95 
 
 		 329 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  44.49 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 308 aa  234  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 308 aa  234  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 308 aa  234  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 358 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 358 aa  235  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 308 aa  234  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  48.46 
 
 		 335 aa  235  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  48.28 
 
 		 366 aa  235  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 358 aa  234  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 		 308 aa  234  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  42.64 
 
 		 564 aa  234  9e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0500  ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6951  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  48.45 
 
 		 624 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.77 
 
 		 337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.77 
 
 		 337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0876  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  46.46 
 
 		 345 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.77 
 
 		 337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.03 
 
 		 332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.77 
 
 		 337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.77 
 
 		 337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  48.24 
 
 		 336 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1582  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.83 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.322929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2910  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.06 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1839  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.18 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2128  ATP-binding protein of oligopeptide ABC transporter  51.56 
 
 		 345 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  48.46 
 
 		 555 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  50.98 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.39 
 
 		 334 aa  232  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.74 
 
 		 349 aa  231  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  48.24 
 
 		 336 aa  231  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.01 
 
 		 334 aa  231  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  46.01 
 
 		 334 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.01 
 
 		 334 aa  231  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1078  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 334 aa  231  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.01 
 
 		 334 aa  231  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.01 
 
 		 334 aa  231  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.69 
 
 		 368 aa  231  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  46.01 
 
 		 334 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.01 
 
 		 334 aa  231  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.01 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.81 
 
 		 344 aa  230  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0578  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 		 464 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.47 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3617  ABC transporter-related protein  51.36 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.606564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  48.06 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  50 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1586  ABC transporter related  48.83 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  50 
 
 		 350 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>