117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4375 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4375  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
240 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  90.42 
 
 
245 aa  400  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  75.83 
 
 
241 aa  348  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0233536  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0905  protein of unknown function DUF1332  75.83 
 
 
241 aa  348  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0299728  normal  0.285713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  76.25 
 
 
241 aa  347  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  74.48 
 
 
246 aa  315  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.78 
 
 
236 aa  229  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1897  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.49 
 
 
235 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.394264  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1731  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.79 
 
 
236 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2019  heat shock protein DnaJ-like  55.96 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37079  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1445  DnaJ domain-containing protein  48.94 
 
 
236 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0302292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1401  DnaJ domain-containing protein  48.94 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.382181  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  44.12 
 
 
235 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2105  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.02 
 
 
235 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  43.48 
 
 
257 aa  184  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2608  heat shock protein DnaJ domain protein  43.7 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221974  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0785  putative heat shock protein DnaJ  44.07 
 
 
227 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.07 
 
 
227 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525604  hitchhiker  0.00758559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2908  molecular chaperone DnaJ family  44.12 
 
 
245 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0737  heat shock protein DnaJ domain protein  43.97 
 
 
227 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.07 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32724  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3389  heat shock protein DnaJ-like  42.98 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2092  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.17 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.764372  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1860  heat shock protein DnaJ-like  42.06 
 
 
235 aa  168  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1801  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.89 
 
 
241 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.42 
 
 
231 aa  158  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2884  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.58 
 
 
256 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842041  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.14 
 
 
251 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1139  heat shock protein DnaJ domain protein  39.05 
 
 
275 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632785  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  28.36 
 
 
270 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  27.99 
 
 
271 aa  99  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  28.74 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  29.66 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  30.34 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  30.71 
 
 
262 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  28.46 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  30.71 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  30.34 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  29.28 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  31.27 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.74 
 
 
260 aa  92.8  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  26.15 
 
 
259 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  29.73 
 
 
256 aa  89  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  29.52 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  29.28 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  28.29 
 
 
257 aa  87  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  29.28 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  29.28 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  25.78 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  26.67 
 
 
273 aa  86.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  28.46 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  28.47 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.3 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.57 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  25.47 
 
 
271 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  25.47 
 
 
271 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  23.67 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  25.27 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  25.27 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  25.09 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  25.47 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  25.27 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  25.09 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  25.09 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  25.09 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  24.44 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  24.44 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  24.44 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  24.44 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  24.44 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  25.09 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  24.72 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  24.54 
 
 
273 aa  75.1  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  27.54 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  28.46 
 
 
257 aa  72  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  25.29 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  21.48 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  21.13 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03720  DnaJ domain containing protein  26.72 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.338466  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.1 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0557  DnaJ domain-containing protein  26.7 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  25.35 
 
 
264 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  25.38 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  25.5 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0826  heat shock protein DnaJ domain protein  27.94 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000315568  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  26.6 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  23.81 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  26.46 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  26.46 
 
 
255 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0557  DnaJ-like protein DjlA, putative  25.19 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  40 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  27.69 
 
 
255 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0438  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.07 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  24.57 
 
 
283 aa  55.5  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  26.39 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3631  Dna-J like membrane chaperone protein  22.49 
 
 
291 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.46 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424531  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  25 
 
 
284 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.02 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  34.85 
 
 
286 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>