40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3777 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3777  OsmC family protein  100 
 
 
162 aa  326  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358184  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1205  OsmC family protein  60.96 
 
 
147 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274132  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1365  OsmC family protein  60.96 
 
 
147 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1144  OsmC family protein  58.9 
 
 
147 aa  175  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2284  OsmC family protein  57.86 
 
 
147 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3747  OsmC family protein  49.65 
 
 
148 aa  140  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49110  redox protein  46.15 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2833  OsmC family protein  42.36 
 
 
158 aa  124  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  hitchhiker  0.00176763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2200  OsmC family protein  43.84 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0042  OsmC family protein  42.74 
 
 
162 aa  100  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4182  OsmC family protein  37.59 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1521  hypothetical protein  39.57 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.483941  normal  0.516484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  25.86 
 
 
140 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03308  osmotically inducible protein  23.28 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0122  OsmC family protein  25.74 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  26.96 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  26.96 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3893  OsmC family protein  27.83 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  26.92 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  25.96 
 
 
139 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  25.96 
 
 
139 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  25.96 
 
 
139 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5252  OsmC family protein  26.15 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  26.09 
 
 
139 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4973  OsmC family protein  26.15 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4884  OsmC-like protein  26.15 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0898256  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  26.09 
 
 
139 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0773  hypothetical protein  26.21 
 
 
125 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000235765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0701  hypothetical protein  25.23 
 
 
125 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0555  OsmC-like protein  25.47 
 
 
125 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000799335  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  27 
 
 
139 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  27 
 
 
139 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  27 
 
 
139 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  25.96 
 
 
139 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  25.96 
 
 
139 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  27.69 
 
 
177 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0556  OsmC-like protein  25.47 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283398  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  28.57 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0680  hypothetical protein  26.21 
 
 
125 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4658  hypothetical protein  26.21 
 
 
125 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  hitchhiker  7.91751e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>