37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1136 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1136  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
273 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3529  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.66 
 
 
361 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  0.0139793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0869  hypothetical protein  37.29 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.45 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2959  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.91 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1300  hypothetical protein  30.91 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2732  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.7 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05520  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.09 
 
 
308 aa  56.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000494508  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5022  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.34 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0363817  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5780  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.29 
 
 
430 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313383  normal  0.564601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1577  hypothetical protein  28.76 
 
 
392 aa  53.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.353635  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4217  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 
384 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0022  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 
520 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.3 
 
 
256 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4695  acid phosphatase  31.4 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1749  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  34.25 
 
 
403 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30 
 
 
172 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0243  putative acid phosphatase  28.89 
 
 
249 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28361  hypothetical protein  35.71 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.58 
 
 
178 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0690  Acid phosphatase  32.2 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02380  putative acid phosphatase  37.8 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.25 
 
 
178 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.25 
 
 
178 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0269  putative acid phosphatase  37.8 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0006  putative acid phosphatase  27.7 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 
357 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.73 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4670  putative acid phosphatase  31.4 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4680  putative acid phosphatase  32.14 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.63 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.87 
 
 
171 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.72 
 
 
360 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4714  putative acid phosphatase  32.14 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225628  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.59 
 
 
201 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.59 
 
 
201 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
157 aa  42  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>