31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0060 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  91.62 
 
 		 2964 bp  791    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0060    100 
 
 		 695 bp  1378    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  85.13 
 
 		 2940 bp  490  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  82.63 
 
 		 2943 bp  365  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  81.82 
 
 		 2943 bp  323  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  81.85 
 
 		 2943 bp  305  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  81.32 
 
 		 2943 bp  301  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  93.51 
 
 		 2991 bp  113  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  89.47 
 
 		 3006 bp  109  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  89.47 
 
 		 3078 bp  109  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  87.85 
 
 		 2970 bp  109  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  89.89 
 
 		 2913 bp  105  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  88.42 
 
 		 3039 bp  101  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  88.42 
 
 		 3000 bp  101  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  84.8 
 
 		 2922 bp  97.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  84.38 
 
 		 2922 bp  95.6  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  92.54 
 
 		 2961 bp  93.7  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  87.37 
 
 		 2961 bp  93.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  89.61 
 
 		 2985 bp  89.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  86.96 
 
 		 3006 bp  87.7  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  87.21 
 
 		 2970 bp  83.8  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  90.77 
 
 		 2976 bp  81.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  88.73 
 
 		 2967 bp  77.8  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  85.06 
 
 		 2889 bp  69.9  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  88.71 
 
 		 2853 bp  67.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  85.19 
 
 		 2952 bp  65.9  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  82.69 
 
 		 2862 bp  63.9  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  89.29 
 
 		 2976 bp  63.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  82.18 
 
 		 2895 bp  58  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0093  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  96.43 
 
 		 1128 bp  48.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0532075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1576  gid protein  96.43 
 
 		 1332 bp  48.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0865882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>