20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1901 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1901  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  673    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0097  hypothetical protein  30.15 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152524 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1524  protein of unknown function DUF1002  30.24 
 
 
325 aa  93.2  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.759287  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0963  hypothetical protein  28.63 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0450638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2761  hypothetical protein  27.54 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4284  hypothetical protein  25 
 
 
288 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3818  hypothetical protein  25 
 
 
288 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3803  hypothetical protein  25 
 
 
288 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4171  hypothetical protein  25.68 
 
 
288 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0571677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4083  hypothetical protein  25 
 
 
288 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000236834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3973  hypothetical protein  25 
 
 
288 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1067  hypothetical protein  25.68 
 
 
288 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  0.659791 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1253  hypothetical protein  28.83 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4132  hypothetical protein  24.66 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.795282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4194  hypothetical protein  24.66 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3892  hypothetical protein  25.85 
 
 
288 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2358  hypothetical protein  36.17 
 
 
303 aa  49.7  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0383  protein of unknown function DUF1002  26.86 
 
 
292 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1568  hypothetical protein  31.25 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00354589  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2241  protein of unknown function DUF1002  33.63 
 
 
296 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000812091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>