287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1554 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1554  ferrochelatase  100 
 
 		 310 aa  643    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000841377  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0412  ferrochelatase  49.03 
 
 		 315 aa  315  5e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.341574  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1661  ferrochelatase  42.07 
 
 		 318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03842  ferrochelatase  40.06 
 
 		 321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  40.32 
 
 		 425 aa  245  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  39.75 
 
 		 368 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  40.32 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  40.06 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  41.21 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  41.21 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  41.21 
 
 		 320 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  41.21 
 
 		 320 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  41.08 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  41.08 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0520  ferrochelatase  40.76 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0674477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  41.08 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  40.89 
 
 		 320 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  40.76 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  40.98 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  40.76 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  40.76 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  40.76 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  40.98 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  40.76 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  40.38 
 
 		 320 aa  232  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  37.18 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  39.3 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  38.41 
 
 		 321 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  37.58 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  37.58 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3991  ferrochelatase  38.87 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.4603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  37.58 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  38.12 
 
 		 364 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  36.56 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  38.87 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  38.85 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  37.7 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  37.34 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1664  ferrochelatase  36.54 
 
 		 320 aa  225  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1736  ferrochelatase  36.54 
 
 		 320 aa  225  6e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  37.3 
 
 		 373 aa  225  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  37.38 
 
 		 352 aa  225  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  37.38 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  38.24 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  36.68 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  36.36 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  38.24 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  37.3 
 
 		 354 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  40.62 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  36.56 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  40.62 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  36.76 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  37.19 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  37.46 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  37.85 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  34.48 
 
 		 330 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  37.27 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  37.27 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  36.84 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  37.15 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  37.27 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  36.88 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  37.81 
 
 		 365 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  38.7 
 
 		 350 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  36.62 
 
 		 371 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  38.82 
 
 		 353 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  36.68 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  36.68 
 
 		 348 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  35.85 
 
 		 367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  36.96 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0816  ferrochelatase  37.34 
 
 		 322 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.213552  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  36.59 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  37.42 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  36.48 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  37.74 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  34.89 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  38.49 
 
 		 398 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  36.89 
 
 		 338 aa  212  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  39.41 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  36.62 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  36.28 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  37.22 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  36.62 
 
 		 371 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  35.74 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  36.59 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  36.59 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  36.59 
 
 		 337 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  36.59 
 
 		 337 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  36.31 
 
 		 371 aa  208  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  37.07 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  38.56 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  37.3 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  37.3 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  35.96 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  35.96 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  37.3 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  35.96 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2060  ferrochelatase  34.44 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000118171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  35.69 
 
 		 367 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  39.94 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>