More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1405 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1405  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
241 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1683  IS605 family transposase OrfB  95.02 
 
 
416 aa  481  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0073  IS605 family transposase OrfB  89.12 
 
 
418 aa  447  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  40.68 
 
 
383 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  40.25 
 
 
383 aa  184  9e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  40.25 
 
 
373 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  40.25 
 
 
383 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  39.41 
 
 
373 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  40.17 
 
 
372 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  40.17 
 
 
372 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  40.17 
 
 
372 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  39.24 
 
 
373 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  39.74 
 
 
372 aa  177  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  38.89 
 
 
373 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0404  transposase  39.32 
 
 
259 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  39.32 
 
 
373 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  39.32 
 
 
373 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  39.32 
 
 
373 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  37.5 
 
 
370 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  36.67 
 
 
370 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  37.61 
 
 
384 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  37.72 
 
 
384 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  39.74 
 
 
391 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  37.18 
 
 
384 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  37.61 
 
 
384 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1623  IS605 family transposase OrfB  37.35 
 
 
391 aa  159  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  36.75 
 
 
384 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  37.18 
 
 
384 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  37.18 
 
 
384 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  37.18 
 
 
384 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  37.18 
 
 
384 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  37.87 
 
 
384 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0227  IS605 family transposase OrfB  37.65 
 
 
391 aa  158  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0173812  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  36.67 
 
 
326 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  36.75 
 
 
384 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  37.18 
 
 
384 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1049  ISCpe2, transposase orfB  36.75 
 
 
384 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00154487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  36.75 
 
 
384 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  36.75 
 
 
383 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  36.44 
 
 
368 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  38.03 
 
 
391 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  36.75 
 
 
384 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  35.12 
 
 
405 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  39.57 
 
 
391 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  36.6 
 
 
383 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  39.22 
 
 
403 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  36.17 
 
 
383 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  39.22 
 
 
403 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  39.22 
 
 
403 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  39.22 
 
 
403 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  39.22 
 
 
403 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.78 
 
 
395 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4125  transposase  38.33 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0035841 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  35.98 
 
 
424 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  35.68 
 
 
388 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  36.87 
 
 
362 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  34.58 
 
 
410 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  35.04 
 
 
383 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  38.58 
 
 
440 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  35.47 
 
 
383 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  35.47 
 
 
383 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  37.61 
 
 
403 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  37.5 
 
 
405 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  36.36 
 
 
384 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  34.19 
 
 
383 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  34.19 
 
 
383 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  37.45 
 
 
408 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  34.19 
 
 
383 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  34.19 
 
 
383 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  34.58 
 
 
410 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  36.28 
 
 
406 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  33.89 
 
 
378 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  36.68 
 
 
393 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.44 
 
 
381 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  35.5 
 
 
401 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  34.8 
 
 
404 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  34.8 
 
 
404 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  40 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  35.34 
 
 
370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  36.21 
 
 
377 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  35.78 
 
 
304 aa  139  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  39.5 
 
 
363 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  34.91 
 
 
370 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  36.21 
 
 
373 aa  138  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  34.85 
 
 
394 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.34 
 
 
372 aa  139  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  34.85 
 
 
394 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  40.79 
 
 
435 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  39 
 
 
363 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  39 
 
 
363 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.02 
 
 
376 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  39 
 
 
363 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  34.89 
 
 
381 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  35.54 
 
 
403 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  34.62 
 
 
390 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  34.48 
 
 
370 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.83 
 
 
461 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  39 
 
 
363 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  39 
 
 
363 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3904  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  35.14 
 
 
422 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.687353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>