26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0679 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0679  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  141  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000935309  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0795  hypothetical protein  60 
 
 
73 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141978  hitchhiker  5.14302e-24 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1203  hypothetical protein  55.71 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000597584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1404  hypothetical protein  60 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.037526  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1431  hypothetical protein  60 
 
 
80 aa  63.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.336499  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2334  hypothetical protein  62.9 
 
 
72 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000047749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2124  protein of unknown function UPF0154  58.06 
 
 
70 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1243  protein of unknown function UPF0154  56.45 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000114476  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl348  unknown transmembrane protein  42.62 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.7448e-34  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1404  hypothetical protein  35.29 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000024693  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1601  hypothetical protein  41.79 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268086  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0914  hypothetical protein  68.18 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0261  hypothetical protein  40.74 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0972  hypothetical protein  41.54 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0493575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3367  hypothetical protein  65.38 
 
 
73 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000120792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3740  hypothetical protein  65.38 
 
 
73 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000820141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3788  hypothetical protein  65.38 
 
 
73 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1526  hypothetical protein  65.38 
 
 
73 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000257253  hitchhiker  0.00441969 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3697  hypothetical protein  65.38 
 
 
73 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000176489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3716  hypothetical protein  65.38 
 
 
73 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000393903  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3742  hypothetical protein  65.38 
 
 
73 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000939903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3386  hypothetical protein  65.38 
 
 
73 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000105781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3434  hypothetical protein  65.38 
 
 
73 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.0722700000000004e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3468  hypothetical protein  65.38 
 
 
73 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000142472  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0301  hypothetical protein  35.21 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0609  hypothetical protein  38.3 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.209843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>