63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0304 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0304  ribonuclease III  100 
 
 
137 aa  284  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000121924  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0339  hypothetical protein  64.23 
 
 
158 aa  165  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203388  hitchhiker  0.000000343763 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0208  hypothetical protein  58.4 
 
 
128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0118  hypothetical protein  58.4 
 
 
133 aa  154  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1823  ribonuclease III family protein  56 
 
 
127 aa  149  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2042  ribonuclease III family protein  58.68 
 
 
133 aa  147  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1426  ribonuclease III family protein  48.84 
 
 
134 aa  135  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000290705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0085  hypothetical protein  51.59 
 
 
135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000804774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0085  ribonuclease III  51.2 
 
 
135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.46597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5215  hypothetical protein  51.2 
 
 
135 aa  124  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527378  unclonable  5.1229600000000003e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0101  hypothetical protein  51.2 
 
 
135 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0121  hypothetical protein  51.2 
 
 
135 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000631862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0087  hypothetical protein  51.2 
 
 
135 aa  124  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0090  hypothetical protein  51.2 
 
 
135 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0086  hypothetical protein  51.2 
 
 
135 aa  124  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0111  hypothetical protein  51.2 
 
 
135 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0092222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0090  hypothetical protein  51.2 
 
 
135 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0851782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0090  hypothetical protein  51.2 
 
 
135 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000630531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0087  ribonuclease III  49.6 
 
 
141 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0553  hypothetical protein  48.72 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0567  hypothetical protein  48.72 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0091  ribonuclease III  50.79 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000109584  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2736  hypothetical protein  47.2 
 
 
136 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2731  ribonuclease III  46.02 
 
 
137 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0171  hypothetical protein  42.15 
 
 
132 aa  104  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.241857  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2422  hypothetical protein  46.4 
 
 
136 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0399  ribonuclease III  43.8 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3323  ribonuclease III  41.8 
 
 
144 aa  95.9  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.545718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3321  ribonuclease III  41.67 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000186185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00970  ribonuclease III  41.88 
 
 
128 aa  90.1  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2061  hypothetical protein  39.17 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0194  ribonuclease III  41.32 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0360608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2483  ribonuclease III  38.52 
 
 
127 aa  84.3  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000130783  normal  0.0178279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0266  ribonuclease III  37.59 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000768224  normal  0.0115191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0172  ribonuclease III  38.94 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000401793  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2354  hypothetical protein  37.82 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0847  hypothetical protein  42.11 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374765  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13944  predicted protein  33.33 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2049  ribonuclease III  36.61 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000924659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1940  ribonuclease III  37.3 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.695553  normal  0.347007 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0597  hypothetical protein  35.04 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1154  hypothetical protein  35.34 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.784455  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0700  ribonuclease III  35.04 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0261  hypothetical protein  33.93 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09301  hypothetical protein  33.93 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0249476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3685  ribonuclease III  35.59 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.449884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2425  ribonuclease III  35.59 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35651  predicted protein  36.11 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0106651 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2284  ribonuclease III  35 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.445322  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92118  predicted protein  29.27 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2312  ribonuclease III  31.45 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.918616  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15791  hypothetical protein  36.84 
 
 
135 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1305  hypothetical protein  31.86 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0054  ribonuclease III  34.45 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0917731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3194  ribonuclease III  31.09 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139584 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1085  ribonuclease III  32.2 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1035  ribonuclease III  32.2 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4412  ribonuclease III  32.5 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2120  ribonuclease III  34.29 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06951  hypothetical protein  31.86 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.056315  normal  0.0999203 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0850  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10321  hypothetical protein  29.75 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.730053  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09111  hypothetical protein  29.31 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.812388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>