17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0022 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0022  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0067  hypothetical protein  29 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.206847  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1947  hypothetical protein  27.08 
 
 
267 aa  93.6  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4003  hypothetical protein  25.17 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3406  hypothetical protein  26.77 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.621085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5647  yycI protein  24.54 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0613428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5586  yycI protein  24.18 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5569  yycI protein  24.18 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5175299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5144  hypothetical protein  24.18 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5160  hypothetical protein  24.18 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5612  hypothetical protein  24.28 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5349  yycI protein  24.18 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000493723  hitchhiker  0.00000000000000821365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3535  hypothetical protein  23.13 
 
 
260 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5712  hypothetical protein  23.81 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5316  yycI protein  23.81 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5256  hypothetical protein  23.36 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2531  yycI protein  24.29 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>