206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2827 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2827  flavoprotein WrbA  100 
 
 		 150 aa  310  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3223  WrbA family protein  100 
 
 		 150 aa  310  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  57.58 
 
 		 200 aa  207  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  57.58 
 
 		 200 aa  207  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  48.22 
 
 		 199 aa  175  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  47.47 
 
 		 200 aa  174  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  48.99 
 
 		 200 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  49.49 
 
 		 200 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  48.99 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  48.99 
 
 		 200 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  48.99 
 
 		 200 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  48.48 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  48.48 
 
 		 200 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  48.48 
 
 		 200 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  47.21 
 
 		 201 aa  169  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  48.48 
 
 		 200 aa  169  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  48.51 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  46.23 
 
 		 201 aa  168  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  72.57 
 
 		 199 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  46.15 
 
 		 206 aa  151  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  43 
 
 		 203 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  44.22 
 
 		 208 aa  145  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  58.62 
 
 		 212 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  45.69 
 
 		 199 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  43.65 
 
 		 200 aa  144  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  43 
 
 		 207 aa  144  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  44.62 
 
 		 206 aa  143  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  41.58 
 
 		 212 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  42.71 
 
 		 200 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  45.69 
 
 		 199 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  44.95 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  44.95 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  44.95 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3178  flavoprotein WrbA  60.53 
 
 		 204 aa  141  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  43.15 
 
 		 199 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  59.29 
 
 		 203 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  41.62 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  41.5 
 
 		 203 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  41.92 
 
 		 199 aa  137  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  43.65 
 
 		 199 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  42.64 
 
 		 199 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  41.41 
 
 		 199 aa  137  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  41.62 
 
 		 199 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  42.64 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  42.64 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  42.13 
 
 		 199 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  42.13 
 
 		 199 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  42.64 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  43.43 
 
 		 199 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  42.64 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  42.64 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  58.77 
 
 		 204 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  42.64 
 
 		 199 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  44.16 
 
 		 199 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  40.61 
 
 		 198 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  43.15 
 
 		 198 aa  133  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  42.13 
 
 		 198 aa  133  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  41.92 
 
 		 199 aa  133  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  42.13 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  42.13 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  42.13 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  42.13 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  42.13 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  42.13 
 
 		 199 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  42.13 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  42.13 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  42.13 
 
 		 199 aa  131  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  42.64 
 
 		 200 aa  131  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1932  TrpR binding protein WrbA  58.93 
 
 		 199 aa  130  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4139  flavoprotein WrbA  44.67 
 
 		 198 aa  126  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384114  unclonable  0.00000000000397831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  40.61 
 
 		 199 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.02 
 
 		 202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  53.51 
 
 		 204 aa  124  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  39.59 
 
 		 199 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  41.12 
 
 		 199 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1023  flavoprotein WrbA  54.39 
 
 		 199 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  39.09 
 
 		 199 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  39.9 
 
 		 199 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1914  TrpR binding protein WrbA  49.12 
 
 		 208 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.936643 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8249  flavoprotein WrbA  53.51 
 
 		 199 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2136  TrpR binding protein WrbA  39.09 
 
 		 199 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  40.1 
 
 		 198 aa  120  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5226  TrpR binding protein WrbA  42.02 
 
 		 203 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  53.04 
 
 		 204 aa  117  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2222  flavoprotein WrbA  42.42 
 
 		 203 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1341  TrpR binding protein WrbA  51.75 
 
 		 199 aa  110  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  37.37 
 
 		 198 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  43.86 
 
 		 218 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.62 
 
 		 200 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  45 
 
 		 198 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  44.52 
 
 		 205 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  44.35 
 
 		 199 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  42.86 
 
 		 197 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.45 
 
 		 198 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  46.28 
 
 		 198 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  45 
 
 		 201 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04240  cytoplasm protein, putative  41.03 
 
 		 211 aa  92  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.538448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  46.28 
 
 		 198 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  45 
 
 		 201 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  44.17 
 
 		 197 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>