More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2626 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3019  phosphocarrier protein HPr  100 
 
 		 90 aa  185  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.330484  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2626  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  100 
 
 		 90 aa  185  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.325956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0468  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  61.18 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278707  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  53.49 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.29 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0298  HPrNtr  53.49 
 
 		 89 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  53.57 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  52.33 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  51.16 
 
 		 89 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 		 89 aa  97.1  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4083  phosphoryl transfer system, HPr  53.49 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.49 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0744  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  58.75 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0540  hypothetical protein  53.49 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0516  hypothetical protein  53.49 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  50 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  50 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.84 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  48.84 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  50 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1657  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.22 
 
 		 89 aa  93.2  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.769211 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  53.01 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  53.49 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  53.49 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  51.16 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1952  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.22 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0353  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.33 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000307134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2760  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.15 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1031  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.49 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0408  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.84 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1281  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.19 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0291  phosphocarrier, HPr family  47.67 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0296  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.67 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0324  phosphocarrier protein HPr  54.32 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273003  normal  0.0186594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.84 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5437  phosphocarrier, HPr family  54.76 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  51.81 
 
 		 89 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0593  HPrNtr  48.28 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.040328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0357  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.62 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2387  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.66 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357738  hitchhiker  0.00387358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  48.19 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1288  HPrNtr  48.81 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12196  hitchhiker  0.00000200864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0229  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.38 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0207173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1234  HPr family phosphocarrier protein  53.66 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.12 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1396  phosphocarrier, HPr family  53.66 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.135473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2052  HPrNtr  50.6 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.67872  normal  0.126322 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.44 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0467  HPrNtr  47.62 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2966  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.24 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.351605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57980  putative phosphoryl carrier protein  49.41 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2095  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5039  phosphocarrier protein HPr  49.41 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.37142  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2014  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.205162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4151  phosphocarrier HPr protein  49.38 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12750  Phosphocarrier NPr protein  46.51 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0371  phosphotransferase system, HPr  46.43 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2849  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.44 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531241  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.43 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0541  HPrNtr  48.24 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0319  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.62 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.734437  normal  0.80364 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2560  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.62 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0751  phosphotransferase system HPr enzyme  42.05 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0152  HPrNtr  45.12 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0157  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.34 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  43.68 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0665  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.05 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4094  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.86 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0707453  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0048  phosphocarrier protein HPr  48.81 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4267  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.62 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4457  phosphocarrier protein HPr  48.15 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.576235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0159  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.12 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0602  HPrNtr  51.16 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0170  phosphocarrier, HPr family  45.12 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0397  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.83 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.081426  normal  0.0975704 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0756  phosphocarrier protein HPr  43.37 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1209  phosphocarrier protein HPr  43.37 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3575  HPr family phosphocarrier protein  48.81 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0853  HPrNtr  50 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  45.12 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0987  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.38 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0207  phosphotransferase system  46.51 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0948  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.38 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  43.37 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0955  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.38 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0824  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.19 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0980  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.83 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>