73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1837 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1837  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 
344 aa  668    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370163  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2179  sulfur reductase, membrane subunit, putative  100 
 
 
344 aa  668    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.247784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  32.81 
 
 
304 aa  139  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  31.06 
 
 
304 aa  132  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0309  Polysulphide reductase NrfD  37.2 
 
 
299 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000856639  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  33.54 
 
 
304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  32.51 
 
 
304 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  29.88 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4106  polysulphide reductase NrfD  28.34 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354906  normal  0.247792 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  28.92 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  30.06 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4283  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  28.4 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0516  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  28.27 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  29.46 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0183  polysulphide reductase, NrfD  27.84 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3835  polysulphide reductase, NrfD  28.99 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4151  polysulphide reductase NrfD  27.84 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0184  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.84 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  25.56 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3960  polysulphide reductase, NrfD  28.99 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  25.88 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3762  polysulphide reductase, NrfD  28.7 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3965  polysulphide reductase NrfD  26.9 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0315  polysulphide reductase, NrfD  28.11 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0243  polysulphide reductase, NrfD  28.21 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  31.02 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  26.51 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2917  Polysulphide reductase NrfD  28.97 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3984  polysulphide reductase, NrfD  24.93 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  25.24 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  27.88 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0658  Polysulphide reductase NrfD  29.29 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.245596  hitchhiker  0.00748855 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2318  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  27.11 
 
 
294 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16800  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  29.19 
 
 
334 aa  60.1  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3158  polysulphide reductase, NrfD  29.56 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2141  Polysulphide reductase NrfD  28.21 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0724041  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  24.68 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0242  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.43 
 
 
313 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  26.86 
 
 
323 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0936  polysulphide reductase, NrfD  28.74 
 
 
290 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00000369278  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  24.68 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  24.76 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3561  polysulphide reductase, NrfD  26.9 
 
 
316 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.90261  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2402  Polysulphide reductase NrfD  27.56 
 
 
331 aa  53.9  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000296698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  27.78 
 
 
331 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  26.37 
 
 
348 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2732  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.43 
 
 
320 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  26.91 
 
 
330 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3617  polysulphide reductase, NrfD  24.28 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02080  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  26.23 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  28.53 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0610  Polysulphide reductase NrfD  29.39 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1916  polysulphide reductase  26.16 
 
 
324 aa  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4060  polysulfide reductase, subunit C  24.28 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2904  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  28.95 
 
 
313 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.554109  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0613  polysulphide reductase, NrfD  23.89 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  33.97 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0498  polysulphide reductase, NrfD  23.53 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  26.98 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0933  Polysulphide reductase NrfD  23.16 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.702618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3779  polysulphide reductase, NrfD  24.52 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0557  polysulphide reductase NrfD  24.52 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2429  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.8 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3249  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.08 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0533  polysulphide reductase NrfD  24.52 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0487  polysulphide reductase, NrfD  24.54 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0606  polysulphide reductase, NrfD  22.76 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0561  Polysulphide reductase NrfD  24.52 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3037  polysulphide reductase NrfD  24.77 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1872  Polysulphide reductase NrfD  29.73 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  27.95 
 
 
313 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4539  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.64 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  23.56 
 
 
400 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>